二战中日军的足迹遍布整个亚洲国家，对各国进行了军事摧残，后来新加坡大屠杀，南京大屠杀，马尼拉大屠杀被称为三大惨案，也称为三大暴行。

新加坡沦陷后是指日本统治新加坡的时期。日军尤其是宪兵队对当地的华人做出了诸多暴行，为报复新加坡华侨对中国抗战的支援，以及华侨对日军的抵抗行动，日本第25军司令官山下奉文便与参谋长铃木宗作和参谋主任杉田大佐等人一起策划了对新加坡华人的"肃清行动"。日军从1942年2月18日至25日进行了大检证又称肃清。他们在判定出敌对分子后，当即处置(死刑)。因为侦查的时候没有记录的关系，没有人知道真正的伤亡人数。最后日方抓走了几万人，当中绝大多数被带到郊区或偏远的海边予以集体枪杀，剩下则被送到泰国建造"死亡铁路"。但是日本和南洋两方都有不同的总数，日本的官方数字是5,000，可是新加坡华社给出的数字是100,000。

南京大屠杀是侵华日军公然违反国际条约和人类基本道德准则，是日军在侵华战争期间无数暴行中最突出、最有代表性的一例之一。侵华日军于南京及附近地区进行长达6周的有组织、有计划、有预谋的大屠杀和奸淫、放火、抢劫等血腥暴行，在南京大屠杀中，大量平民及战俘被日军杀害，无数家庭支离破碎，南京大屠杀的遇难人数超过30万。其中就有惨无人道的杀人竞赛，谁先杀满100人为胜者，日军侵占南京期间强奸了成千上万的妇女，他们不分昼夜并在受害妇女的家人面前施行强暴。有些妇女被日军强奸了好几次，往往有妇女受不住日军的折磨而死。除此之外，日军还强迫乱伦行为。估计当时发生的强暴案可能超过20000宗。

马尼拉大屠杀，也称马尼拉大惨案。1941年12月，美军撤出马尼拉后，宣布马尼拉为不设防城市，日军兵不血刃的侵占了马尼拉。1945年1月，美军从莱特湾出航，在林加延登陆吕宋岛，同时，美军第11空降师登陆纳苏格布，直指马尼拉。攻入城内的美军和日军展开了激烈的巷战。日军撤退过程中，对马尼拉进行了疯狂的破坏的屠杀，大约有四分之 三的建筑被毁，125000多菲律宾人们遭到杀戮。

日军罪行滔天，连孩子也不放过，最残忍的一次是在圣保罗大教堂一次杀害了994名儿童，他们用食物引诱孩子们，当饥饿的孩子们正在吃的时候，日军竟然拉动手榴弹，将九百多名孩子全部炸死，无一生还，可见其已经丧失了人性，残忍至极。