特洛伊战争相传是以争夺世上最漂亮的女人海伦(Helen)为起因，道出以阿伽门农(Agamemnon)及阿喀琉斯(Achilles)为首的希腊军进攻以帕里斯及赫克托尔为首的特洛伊城的十年攻城战。

希腊神话中时常提到特洛伊战争，整个故事是以荷马史诗《伊利亚特》(Iliad)为中心，加上索福克勒斯(Sophocles)的悲剧《埃阿斯》(Ajax)、《菲洛克忒忒斯》(Philoctetes)，欧律庇德斯(Euripides)的悲剧《伊菲格涅娅在奥利斯》(Iphigenia at Aulis)、《安特罗玛克》(Andromache)、《赫库芭》(Hecuba)，维吉尔(Virgil)的史诗《伊尼德》(Aeneid)、奥维德(Ovid)的长诗《古代名媛》(Heroides)等多部著作而成，故事详细地描述了特洛伊战争的情况。

希腊人再次出发，沿途风平浪静，预言家告诉他们必须在莱姆诺斯岛(Lemnos)旁的克律塞岛(Chryse)上对女神克律塞斯(Chryses)作献祭才能攻城顺利，菲洛克忒忒斯知道这个祭坛的位置，领袖们在岛上跟著菲洛克忒忒斯来到祭坛，此时一条大蛇窜出并咬了菲洛克忒忒斯的脚，蛇毒令菲洛克忒忒斯脚痛得很厉害，臭味四溢，他早晚呻吟令大家都埋怨起来，最后奥德修斯建议把他抛弃到莱姆洛斯岛的海岸上，就当菲洛克忒忒斯在船上熟睡之际，领袖们把他放在岛上两个岩石之间，给他留下了弓箭衣服食物，菲洛克忒忒斯就这样被遗下了，但因为没有他是攻不下特洛伊地的，希腊人在围城第十年不得不再请他回来。

希腊人终于来到了特洛伊地的海岸，预言家警告谁第一个踏足海岸的就会先死，奥德修斯为了吸引将士上岸，自己把盾牌扔到岸上，灵活地跳上盾牌，英雄普罗忒西拉奥斯(Protesilaus)渴望建立军功，没留意到奥德修斯的诡计，就立即跳上岸杀敌，特洛伊的英雄赫克托尔以长矛一飞，他就结束了性命，大家万众一心杀敌，特洛伊人抵挡不住退回城里。第二天双方停火收拾尸体和埋葬战士，之后希腊人把船拖上岸并修筑防御工事，阿喀琉斯及大埃阿斯的帐篷设在工事的两端，以便防御偷袭.阿伽门侬及奥德修斯的帐篷则在中央，以便统率全军，修好后就派墨涅拉奥斯及奥德修斯与特洛伊人谈判，他们要求归还财宝及海伦，本来特洛伊人自知理亏已准备接受一切要求，但是帕里斯第一个不从，部份兄弟而支持他，被收买的安提玛科斯(Antimachus)甚至要求逮捕墨涅拉奥斯并处死他。当中特洛伊预言家赫勒诺斯(Helenus)更鼓舞地道神会让特洛伊胜利，最后特洛伊人拒绝和谈，战争正式开始。

希腊人开始围城，攻了三次都无功而还，特洛伊人也不敢贸然出城进攻，希腊人只得侵占附近的城邦，这包括忒涅多斯岛(Tenedos)、莱斯博斯岛(Lesbos)、佩达斯城(Pedas)、吕尔奈斯城(Lyrniseus)等。当中彼奥提亚的忒拜也被占领，此城是赫克托尔妻子安德罗马克(Andromache)之父埃提翁(Eatcon)所治理，阿喀琉斯一天所杀了安德罗马克七个弟兄，并俘虏了阿波罗祭师克律塞斯的女儿克律塞伊斯(Chryseis)及布里塞斯(Briseis)，希腊人把克律塞伊斯送给了阿伽门侬。

这九年间，希腊很多英雄都战死了，包括英雄帕拉墨得斯，他对希腊人作出了无数的贡献，可是奥德修斯出于嫉妒之心，加上当时帕拉墨得斯揭穿了奥德修斯装疯的诡计，奥德修斯就趁帕拉墨得斯想议和时诬陷他，奥德修斯把黄金藏在他的帐篷，并流传他被普里阿摩斯收买了，很多人开始相信，另奥德修斯又伪造文书，阿伽门侬得到文书后，召集所有领袖到帐篷，这包括帕拉墨得斯，帕拉墨得斯百辞莫辩，被判钉上锁链被人用石头砸死，帕拉墨得斯求饶不果后就在海边被处死了，这导致后来他的父亲欧博亚国王瑙普利奥斯(Nauplius)的报复，起初阿伽门侬甚至不允许埋葬帕拉墨得斯的尸体，然而大埃阿斯不相信帕拉墨得斯背叛而安葬了他。

翌晨，宙斯召集众神警告他们今天不可帮任何一面，他乘著马车来到伊达山的山顶观战，战争一直持续到中午，此时宙斯拿出天秤，特洛伊人的一边高举，而希腊军一面则倾到地面，宙斯令雷声作响，希腊军全体撤退，只有涅斯托尔一人留在战场，此时帕里斯射伤了他的马的眼睛，马立即变得不受控制，赫克托尔赶到举剑要杀涅斯托尔，刚好狄奥墨得斯赶到把涅斯托尔拉上自己的战车，便去迎战赫克托尔，他刺中了赫克托尔的驭者，马车不受控制，英雄阿尔克普托勒摩斯(Arheptolem)登上了战车代替驭者，宙斯以闪电投向马前，马吓得乱窜，涅斯托尔劝狄奥墨得斯离开战场，因为宙斯不想见到他的胜利，狄奥墨得斯听从，特洛伊军乘胜追击，赫克托尔对狄奥墨得斯拼命嘲笑，狄奥墨得斯三次想回到战场却都被雷电止住，涅斯托尔明白今天胜利将归特洛伊人，而赫拉请求波塞冬援助希腊军，波塞冬拒绝了她。

战斗直逼至希腊军的围墙边，阿伽门侬请求宙斯帮助，此时宙斯起了怜悯之心，带来了吉兆，一只巨鹰将一只鹿攫起并投在宙斯的神坛上面，希腊人士气大增，当中以狄奥墨得斯最为兴奋杀敌，另外，透克罗斯(Teucer)也杀死了普里阿摩斯的儿子戈尔古提翁(Gorguthion)及阿尔克普托勒摩斯，赫克托尔大怒用巨石打伤了他的肩，幸好大埃阿斯来到掩护他才幸免于难。特洛伊人由围墙攻至希腊军的船边，尽管女神们想帮助希腊军，但宙斯却派使者伊里斯阻止她们并威胁要动怒，女神们都止住了，宙斯对赫拉说在阿伽门侬主动向阿喀琉斯修好前，特洛伊人还要得胜。入夜后，赫克托尔率军在城外扎营，务求明天一举击退希腊军。

第二天的早晨非常奇怪。希腊联军的战舰突然扬帆离开了。平时喧闹的战场变得寂静无声。特洛伊人以为希腊人撤军回国了，他们跑到城外，却发现海滩上留下一只巨大的木马。

特洛伊人惊讶地围住木马，他们不知道这木马是干什么用的。有人要把它拉进城里，有人建议把它烧掉或推到海里。正在这时，有几个牧人捉住了一个希腊人，他被绑着去见特洛伊国王。这个希腊人告诉国王，这个木马是希腊人用来祭祀雅典娜女神的。希腊人估计特洛伊人会毁掉它，这样就会引起天神的愤怒。但如果特洛伊人把木马拉进城里，就会给特洛伊人带来神的赐福，所以希腊人把木马造得这样巨大，使特洛伊人无法拉进城去。特洛伊国王相信了这话，正准备把木马拉进城时，特洛伊的祭司拉奥孔跑来制止，他要求把木马烧掉，并拿长矛刺向木马。木马发出了可怕的响声，这时从海里窜出两条可怕的蛇，扑向拉奥孔和他的两个儿子。拉奥孔和他的儿子拚命和巨蛇搏斗，但很快被蛇缠死了。两条巨蛇从容地钻到雅典娜女神的雕像下，不见了。

希腊人又说，"这是因为他想毁掉献给女神的礼物，所以得到了惩罚。"特洛伊人赶紧把木马往城里拉。但木马实在太大了，它比城墙还高，特洛伊人只好把城墙拆开了一段。当天晚上，特洛伊人欢天喜地，庆祝胜利，他们跳着唱着，喝光了一桶又一桶的酒，直到深夜才回家休息，做着关于和平的美梦。

深夜，一片寂静。劝说特洛伊人把木马拉进城的希腊人其实是个间谍。他走到木马边，轻轻地敲了三下，这是约好的暗号。藏在木马中的全副武装的希腊战士一个又一个地跳了出来。他们悄悄地摸向城门，杀死了睡梦中的守军，迅速打开了城门，并在城里到处点火。隐蔽在附近的大批希腊军队如潮水般涌入特洛伊城。10年的战争终于结束了。希腊人把特洛伊城掠夺成空，烧成一片灰烬。男人大多被杀死了，妇女和儿童大多被卖为奴隶，特洛伊的财宝都装进了希腊人的战舰。海伦也被墨涅依斯带回了希腊。 特洛伊战争就此结束。