民营中小微企业一般在某个行业和技术领域具有产品技术的领先优势，市场活力强，企业运营机制相对灵活，但在“民参军”初期，往往因为对于军工的体制流程不太熟悉，缺乏相应的军工资质，也没有建立稳定的军工市场渠道，需要花费很大的管理成本。
军工集团长期与军方用户部门打交道，对用户的需求相对比较了解，对军工的体制机制比较熟悉，具备比较齐全的军工资质，在切入军工市场时相对比较容易，但存在体制机制相对不灵活、创新活力不够等问题。
民营中小微企业与军工集团之间既存在竞争关系，也具有很大的合作共赢空间。当前军工集团在与民营中小微企业同台竞争时，存在个别恶意竞争的现象，包括利用传统行业垄断优势地位封杀民营中小微企业“民参军”，通过兼并收购等资本手段控制民营中小微企业自主创新等。比较理想的状态是，双方共同把军民融合未来产业发展空间塑造好，把“蛋糕做大”，在产业上下游上建立合作关系，发挥各自优势开拓市场，形成良性的“协同创新生态圈”。具体的形式既可以是业务上的合作，如民营中小微企业向军工集团提供技术产品与协作配套支持，也可以是资本层面的合作，包括军工集团收购民营中小微企业，军工集团参股民营中小微企业，以及在对民营中小微企业技术进行价值评估后，合作建立新的公私混合所有制企业等。
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