上世纪六十年代初期，位于江苏省洪泽县的洪泽湖遭遇大旱，湖水水位一时间下降到了有史以来的最低点。此时盱眙县洪泽湖的西岸，漏出了一些神秘的建筑，这些建筑全部都是大型的石像，形状有的是麒麟，有的是狮子，还有的是战马。除了动物以外，还有一些文武大臣、太监等各种角色的石像。此事一出，立刻引起了考古专家的关注，后经过仔细研究，确定这是朱元璋的祖陵，也就是埋葬朱元璋的高祖、曾祖、祖父等先辈的墓。

于是大家都纳闷了，朱元璋没有什么问题吧，怎么好端端的把自己的祖坟埋在水下面，难道有什么不可告人的秘密吗？难道的这里是一块风水宝地吗？按照过去风水学的说法，此处并不是一块风水宝地，而是一马平川的平原。事实上朱元璋之所以把祖陵选在这个地方，也是迫不得已。毕竟祖父曾祖死的时候朱元璋还没有出世呢，怎去决定祖坟的位置呢？

等到朱元璋成大事后，想过把祖坟迁到一块风水好的地方，但是顾忌到移动祖坟的话会影响王气，从而影响到大明的江山社稷问题，思量再三，就找一些有能力的工匠在原址修建祖陵，尽最大能力把风水改造的旺盛一些。于是大批民工对当时的朱家祖坟进行了改造，该垫高的垫高，该补的补，于是就人为的在祖陵周围修建了河流和山坡，形成了一块所谓的风水宝地。

然而由于古人对于黄河治理的能力有限，历史上发生了好几次夺淮入海的水文现象，简单的说就是黄河下游的河道改道，黄河不往东流，而是往南汇入了淮河，然后从淮河汇入大海。黄河从上游黄土高原带下来的泥沙也沉淀到淮河河道，时间一久，河床升高，导致本身就处于低洼地的明祖陵前后总共8次被大水浸泡，尽管朱元璋的后辈们也想尽办法去治理，可是面对这样的难题，也只能是束手无策。

到了清朝康熙年间，明祖陵彻底被水淹没了，除非遇到大旱的情况，一般是是看不到了。而由于长时间的浸泡，里面的很多建筑都被毁坏了，只有石像等不容易腐蚀的建筑保留了下来，不过也是东倒西歪，根本不像皇家祖陵的样子。就这样明祖陵就被人们遗忘了。考古专家发现后，立刻对名祖陵的建筑进行了修复，经过10年多的努力，基本上恢复了原来的面貌。而明祖陵的墓室，到现在仍旧浸泡在水里面，人们也只能透过水面来想象墓室的模样了。