中国的边检部门从建国以后改变过多次编制，至今也没有完全定型。1983年，全国边防部队划归各武警总队建制。但是到了87年的时候，边防武警又从武警总队中分离，划归公安部领导，也就是后来的公安部四局——边防局，所以现在的边防武警并不属于武警总队管理。

但是北京、上海、天津、海口、深圳、珠海、厦门、汕头、广州这九个城市的边检机关则是在98年从原体制中剥离出来，改编为职业制人民警察，归属公安部六局——出入境管理局垂直领导。从业务上看两者并没有什么区别。

不管哪里的边检一定是属于公安部的，区别在于穿的是一般警察的衣服还是武警的衣服而已。因为在我国，实际上警察可分为职业警察和兵役制警察两种，职业警察就是我们一般看见的民警，穿蓝色衬衣藏青色衣服的，兵役制警察即官方说的公安现役部队，特指公安部下属的边防、消防和警卫三大警种。这三大警种穿武警的衣服，列入武警序列，但是和武警总部没有任何关系。

边检是边防系统（注意不是军队的边防系统）的一部分，隶属公安部，因为任务性质所以参照武装警察部队管理，穿武警的衣服，属于兵役制警察即公安现役部队，但是和武警总部没有任何关系，隶属于公安部边防局。