公元1881年4月8日，慈安太后在钟粹宫暴崩，自此，清朝从两宫皇太后垂帘听政变为慈禧一人大权独揽。由于慈安太后死亡非常突然，不禁使人生疑，究竟是病死还是遭到毒杀，成为晚清宫廷的一大疑案。

在清朝官方文献中，对于慈安太后的死因见于《德宗实录》：“初九日偶染微疴，初十日病势陡重，延至戌时，神思渐散，遂至弥留。”这段记载明确表明慈安是正常生病死亡。民间野史以及清宫题材的影视文学作品，为了使情节曲折离奇引人入胜，更倾向于中毒致死的说法。

中毒致死说认为，慈安太后之死，最大的受益者是慈禧，那么幕后下毒的指使者也必然是慈禧。要说慈禧毒杀慈安的动机，还真有不少。

其一，山东巡抚丁宝桢在慈安太后的授意下，诛杀了安德海，安德海是慈禧最宠信的人，这相当于慈安公开打脸慈禧，不过安德海确实违反了太监不得出京的清朝祖制，慈禧无话可说，只能吃哑巴亏，但以慈禧后来睚眦必报的性格推断，肯定会对慈安产生记恨。

其二，两宫皇太后共同前往清定陵祭拜咸丰帝，因祭拜顺序等礼节问题，慈安曾与慈禧发生过争执。慈禧有意先于慈安祭拜先帝，这令慈安认为不合礼制，慈安是咸丰帝正宫皇宫，而慈禧是秀女出身，母凭子贵成为西宫皇太后。慈禧利用各种机会试图逾越这种嫡庶之别，慈安则以此提醒慈禧，而慈禧非常忌讳这一点。

其三，慈禧与恭亲王奕存在矛盾，慈安虽然表现的无心涉政，但她在政见上与恭亲王奕保持一致，是奕的支持者。慈禧太后要想独揽朝政大权，首先要打压奕的影响和势力，慈安就被慈禧视为绊脚石，慈安一死，奕就会失去靠山，不攻自破。

即使慈安是中毒致死，清朝官方文献也不大可能会如实记载，因为慈禧会从中干预，仅靠官方记载不足以定性慈安太后的真实死因。这种情况下，接近事件内情人士所写的第三方记载反而更具可信度。

翁同龢曾担任同治、光绪两朝帝师，历任工部、户部尚书和军机大臣，还成功为杨乃武与小白菜这一冤案平冤昭雪，为人清廉耿直。翁同龢著有《翁文恭公日记》，记载了当时的很多重要史实和个人观点，被誉为晚清三大日记之一。其中就有关于慈安太后生前身体状况的记载。

在日记中，翁同龢详细记载了慈安太后两次患病经历。一次是同治二年10月9日，慈安26岁时病情“有类肝阙，不能言语”，是明显的脑梗前兆，不过病情较轻，经治疗后康复。第二次是同治八年，慈安33岁“旧疾作，阙逆半时许”，这是脑部供血不足的表现，证实了慈安患有脑疾。在慈安45岁离世的前一日，仍然召集军机大臣商议国事，细心的翁同龢在日记中记载了慈安当日“两颊微赤”，第二日慈安太后猝死。

至晚清时期，毒药有三种类型，一种为腐蚀性，例如砒霜，成分为三氧化二砷，服用后发生口鼻流血及身体扭曲，有明显的中毒特征；一种是麻醉性的，致人昏迷后快速死亡；还有一种是刺激性的，服食后会口吐白沫。慈安在死前一天就已经出现不适症状，死后身体无明显中毒特征，牙口紧闭没有发生呕吐，据此分析，可以排除中毒而死。

从翁同龢日记前后18年对于慈安太后身体状况的记载来看，慈安皇太后应当是患有长期脑部血管疾病，死于脑梗的概率极大，而这种病症也符合突然死亡的特点。翁同龢日记的可信度是比较高的，慈安正常病死说比中毒说更加真实可信。