名侦探柯南跟新到现在曾经让柯南胆寒的酒厂，现在已经变成了卧底泛滥的组织了。

一号卧底：赤井秀一

充满神秘感的FBI搜查官。有极强的狙击能力、推理能力和情报搜集分析能力，车技一流。冷峻，不苟言笑。和琴酒一样都是左撇子，平时总喜欢戴针织帽。曾成功打入黑衣组织内部，并获得“黑麦威士忌”（Rye）的代号。被组织内部称为“银色子弹”。

二号卧底：安室透

本名降谷零 ，化名安室透。真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底 ，组织代号"波本"(Bourbon) 。表面职业为私家侦探、餐厅服务生，在毛利侦探事务所楼下的波洛咖啡厅打工，并拜毛利小五郎为师。擅长搜集情报，有极强的观察力与推理能力。与FBI搜查官赤井秀一相互厌恶，因此伪装成伤疤赤井来观察赤井秀一是否已死。为了调查毛利小五郎与雪莉是否有关联而接近毛利 ，后对柯南的身份产生了兴趣。 对FBI成员进行了一系列试探，推断出赤井秀一未死和赤井假扮为冲矢昴活动。 由赤井秀一揭晓其真名和日本公安警察的身份。

三号卧底：水无怜奈

真名本堂瑛海，伊森·本堂的女儿，本堂瑛佑的姐姐。真实身份是CIA派入黑衣组织进行卧底调查的谍报员，组织代号"基尔(Kir)"。表面身份为日卖电视台女主播(已辞职)。曾于一次暗杀行动中遭遇车祸昏迷，受到FBI保护。之后在FBI的协助下重新进入组织继续卧底，并答应向FBI提供组织情报，条件是FBI对弟弟本堂瑛佑进行保护。

心疼一秒琴酒，每天辛辛苦苦地为组织奋斗，结果手下一大堆卧底，少数几个干正事的又是几个废物，贝尔摩德又是时时刻刻护着柯南，琴酒表示这仗没法打了。