驴子和马同属,但不同种,在外形上也有较大的差别。并且两者在大约400万年前有共同的祖先。虽然对于马的高质量的基因组信息已经获得,但一直未能攻克家驴基因组信息。由于缺少很好的基因组组装方法和策略,一直未能获得质量较好的scaffolds。
近日,法国以及丹麦的科学家们利用一种Chicago HiRise assembly technology的技术,获得了家驴高质量基因组信息,与以往数据相比有了很大程度上的提升。
家驴基因组具有染色体重排的特点,是物种进化的重要表现。染色体重排是指基因从所在的染色体的正常位上易位至染色体的另一个位置上,这种位置改变基因处于激活状态,产生异常基因产物或移动到另一条染色体上,这一过程称为染色体重排.如果染色体重排对物种分化来说是一个稳定、长存的影响因素,则亲缘关系较近的物种之间,染色体重排的情况应该较少。
该研究获得高质量基因组数据将为马科动物以及人类进化提供很好的依据和参考。
本研究已发表在最新一期的Science子刊 Advances 上。
原文:
Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey
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