而对于大家熟知的火器，因为各地府县只是将其作为赋的一部分缴送，因此谈不上标准化。鸟铳在装备进军队后，常常因为有铳管炸裂的危险而使士兵们提心吊胆，以致于士兵不敢双手握铳来作精确的瞄准。而对于火炮，则出现了导火线无法点燃、铅弹与口径尺寸不合等情况。在战术方面，明军甚至缺乏侧翼和后续部队的接应。作战中，又很少形成有效的队形，只是墨守密集队形的战术。因此在两军交战时，往往会造成“一人失利，万人奔溃”的结局。而在面对倭寇有效的战术前，即使士气最高昂的军队，也只是靠着血气之勇猛冲敌阵。因此，战败自然就在所难免了。戚继光到任后，朝廷立即着手募集到资金供他招募和训练新军。在面对火器质量的严峻问题时，他将火器作为辅助战具而只在有限的范围内使用。同时，戚继光创立了鸳鸯阵，在战术上一改之前陈旧的作战观念，既使得不同武器间得以密切配合，又让手下士兵摆脱了对倭人战法的恐惧。从此，倭患对明朝的威胁发生了一个大大的转折。