圣旨代表了皇帝的旨意，包括诏书、诰书、敕书、制书等形式，明清以后，圣旨都以“奉天承运，皇帝（诏、诰、敕、制）曰”这一句开头。按常理来说自然是圣旨最大，毕竟天子代天牧守万民，金口玉言。

在帝制时代，皇帝出口成旨，落纸为诏，具有法理上的最高权威，其他人的旨都无法抗衡。

从帝制法统来说，自然是圣旨比懿旨有效，但在实际执行过程中，皇帝的权威往往也有受到制约的时候，具体情况要具体分析。

一般情况下，太后的懿旨都不涉及政务，只涉及后宫，这是由于古代后宫不得干政的规矩所限，但后宫干政出现的次数也有许多，懿旨有时候是涉及到政务的。

一旦太后懿旨涉及政务，基本就是三种情况，一是该太后为摄政太后，掌控着政权，皇帝为傀儡皇帝，说话不管用，如吕后与汉惠帝、武后与唐中宗等；二是野心家利用太后的权威给自己发动的政变寻找理由，比如高平陵之变司马懿就是打着太后旗号的，在这两种下，明显懿旨更有效。

三则是王朝发生突然变故或是皇位空置的情况下，太后暂时用懿旨发号施令，或指定监国，或另立新君。如明朝土木之变后，明英宗被俘，经太后同意，郕王先为监国，后即位。

不过第一种情况基本不会出现圣旨与懿旨相冲突的情况，因为傀儡皇帝几乎发不出圣旨，即便出现，强势的太后也完全可以一言废止，圣旨的强权只有在具有权力时才能体现。

第两种情况倒是有可能出现二者冲突，但这时政权已经大大不稳，圣旨或是懿旨的实施有很大不确定性，政变获胜者采用哪种就是哪种有效了。

第三种就更不用说了，皇帝都没了，何来圣旨，自然不会出现冲突。