本作的男主角是个重度中二病：冈部伦太郎，自称花名为凤凰院凶真。原本的“未来发明研究所”成员是三个人的小组：队长凶真，男主的青梅竹马真由理，和男主的好朋友黑客桶子（桥田至），由于在时间研究讲座遇到了天才少女牧濑红莉栖后男主首次触发了时间跳跃，在说到时间穿梭机器的发明成果后，红莉栖也加入了研究所，成为第四位labmam与男主一起研究着时间机器。

女主（暂定）红莉栖成为了研究所的核心意见领袖，凭借对时间与记忆的研究，以及对试验的热情，她带着凶真等人研究了一系列的方法，并且成功进行了时间穿梭。

但是很奇怪的是，时间穿梭完成时，只有男主还保留原本的记忆，其他人包括红莉栖在内，都被改写了记忆，只记得改变后的“现实”。

后来还有各种人物的加入，每个人都有自己的理由和要改变的过去，这使得labmam的数量不断增加，过去也被不断的改写，大家都似乎朝着自己想要的方向获得了未来……直到男主的青梅竹马真由理的死，也成为了现实。

此时的研究所已经不再是原本痴人说梦的小打小闹，成功研制了时间跳跃机器后，凶真便冒险回到过去的一天，不断重复着真由理死去的这天，试图改变真由理死去的现实。既然能够改变过去，在世界线收束之前，一定要拯救真由理，一定还有办法！

凶真和红莉栖一起想办法，不断跳跃到过去，取消了之前所改变的过去，虽然这样做的代价就是摧毁了大家的回忆，但是为了拯救真由理的性命，凶真冒着精神崩溃的危险，默默进行到了最后——回到原点，那封最早改变了过去的D-Mail，便是曾经改变了红莉栖的死亡现实。

也就是说，想要拯救真由理的话，红莉栖就会死。最后，凶真与红莉栖互相告白，并决定牺牲了红莉栖，拯救了真由理。

这剧情，真的让人想给编剧寄刀片……

结局是，一个来自未来想要改变过去的女生：铃羽，她告诉了凶真，没有红莉栖的未来，是一片糟糕的。由于红莉栖的死，她对于时间机器的研究落入一个叫SERN的组织手里，并且SERN制作出了时间机器，支配了世界。所以凶真必须要再次回到过去，拯救红莉栖，骗过了现实，骗过了世界，最后，骗过了自己……

这是一部讲述时间跳跃的科学动画，但是，它更加注重这种时间穿越对于人的心理所造成的影响。

当凶真知道自己最亲近的朋友逃不过死亡时，他不断的去麻木自己的恐惧，越来越熟练的去穿越，对朋友的死渐渐习惯。可怕的不是无法改变事实，而是你的内心都忘记了为什么要去改变。

结局是圆满的

拯救了红莉栖之后，凶真也从β线去到了大家理想中的命运石之门世界线。这里是没有时间机器的世界，大家安安稳稳的过着普通的生活。凶真还是会每天中二病发似的喊着要支配世界，红莉栖也在同一个世界进行着对凶真的思念，大家都相信着在未来的一天会相见。大家都想要接受命运石之门的选择。

动画本篇的故事到此为止，看似圆满地回收各个结局，世界朝着安稳的未来发展。但是本薯很担心男主的未来，一个经历过无数次朋友在自己眼前死去，亲手杀死自己心爱的女人，并且目睹大家不同时间线上所做的事情，如果这个人还没疯，那必定是神。

凶真在动画里也曾经几次崩溃痛哭，无法拯救的青梅竹马的死，无法改变结局的心爱人的离去，早就写好的结局无力回天，稍有不慎就会毁掉未来的世界……种种的压力都在他一个人的身上，不管跳跃多少次世界线，都只有他自己留着原本的记忆，只有他是个孤独的观测者，看着世界在变化，人们在变化。

也许他是幸运的，他有红莉栖，一个无论什么都愿意相信和支持他的女人，一个天才研究少女，在关键时刻给予了恰到好处的建议。至少在最后，红莉栖成为了凶真内心的支柱，只要红莉栖在身边，凶真就有成功改变过去的可能性和信心。

我们在看到助手红莉栖与凶真美好结局的时候，也会忍不住热泪盈眶，命运石之门没有什么大道理和矫情，但是真的有生离死别，并且不止一次。只有红莉栖与凶真的这次，我们相信，他们真的不是最后的分别。

因为一切都是命运石之门的选择，他们最后还是在一起了。