在太平天国之后，清朝中已经出现王朝末期的两大征兆，一是曾国藩这样汉人权臣的出现。使得朝廷的权力向汉人身上倾斜，以及很多权力集中在少数几个人手中。二是，清朝出现封疆大吏，比如张之洞之类。正是他们的出现使得中央集权已经大大减弱，比如在甲午战争期间，南方的张之洞等人竟然能够对日宣称中立。

在当时，虽然清政府内忧外患之中。但是清政府还是逐渐意识到，洋人不过是想要贸易，想要从中国获得一些在当时的清政府看来无关紧要的一些权益。清政府最大的敌人还是来自内部。因此清政府不断的催促曾国藩加强对太平天国的进攻。

当曾国藩攻破天京城时，曾国藩的手下发现洪秀全已经去世了，但是洪秀全却刚死了不久。虽然如此，曾国藩令人将其尸体挖出来，弄得粉碎之后再放到大炮中去，一炮就发射出去了。可以说洪秀全死后真的是连灰都没有剩下。虽然我们知道洪秀全是曾国藩最大的敌人，但是曾国藩有如此的憎恨洪秀全吗？

这就要从洪秀全起义的拜上帝教说起，这个宗教其实和现在的邪教的性质非常的像，都有一个具象化的人作为神的代表，然后让信众捐钱捐物。就是一个骗钱骗人的物质宗教。信众也把洪秀全当作是一个精神信仰。这种通俗并且给人许诺美好生活的宗教在老百姓中具有很大的诱惑力。因此洪秀全的宗教具有很强的聚合性和煽动性。而洪秀全又是他们的精神领袖，再者虽然洪秀全死了但是还有很多的部下还在于清廷抗争，洪秀全死后又出现李秀全张秀全，那不是更可怕

对于宗教和文化认同上，曾国藩就曾表达过对太平天国理念的厌恶。曾国藩的这些举动极大的延续了清朝的统治，同时也是对儒家文化的保护。当时曾国藩向乡绅举行募捐的理由就是自诩为儒家文化的保卫者。

此时的曾国藩虽然剿灭了大清最大的匪患太平天国，但随之而来的却是自己地位的不保，他作为汉人已经是位极人臣。虽然之后被调往北京任职，明升暗降把他和湘军军团的联系切断，但依然会引起满清统治者的忌惮和猜疑，灭了太平天国更是让他地位和声望如日中天，如果曾国藩不表达出对朝廷的忠心，对统治正统的维护，他就会迅速被朝廷打压。