历史上王朝官僚制度各不相同，但在隋朝之前，未实施科举制度时，东汉到东晋的官员来源，世袭的门阀后裔已经是主流，这一历史阶段也是门阀世袭制度的兴起。虽然清朝也实施科举制度，但在晚清时，清朝放松科举制，一度兴起晚清“幕府”官僚，这是清朝不同于其他王朝一个很有特色的官僚制度。虽然两个王朝所处的历史阶段不同，官僚制度不同，但两者之间也有着必然的联系。
门阀世袭的弊端
任何一项官僚制度都有两面性，东汉末年、魏晋时期的官僚制度是世袭的官僚制度，特别是西晋建立之后，其门阀官僚世袭制不仅未改变，反而更加兴旺，成为西晋灭亡的一个重要因素。
司马氏统一三国后，建立一个大一统的王朝。但这个王朝的建立，实际上是司马氏整合了曹魏贵族阶层，也就是说在原有官僚阶层基础上建立的一个王朝。
但对于吴、蜀两国的官僚阶层，虽然投降司马氏的官僚继续为官，但已经被司马氏皇族排除在权力核心圈。而寒门子弟更没有希望进入西晋的官僚阶层。司马氏掌控曹魏大权时，曾为司马氏统一做出贡献的邓艾、石苞、张华等寒门子弟，最终受到其他贵族的排挤打压。
西晋官僚制度，实际上是司马氏为首的大官僚，打压曹魏不听话贵族，而形成的另一种官僚阶层，换汤不换药，官僚都来自曹魏时期重臣后裔，或者司马氏亲族一系。
司马氏形成的门阀官僚体系有一个显著的特点，就是官僚之间姻亲、血亲、提携等关系，这就形成了一个牢不可破的官僚世袭网络，而这一网络造成了官僚体系“凝固”状态。很多官僚子孙出生就为官，其官员的素质有高有低，有向低素质发展的趋势。
司马氏延续曹魏门阀官僚体制，虽然很轻松夺取了江山，但这种官僚体系，司马氏又无法改变。于是在官僚贵族阶层就形成了奢侈之风，甚至门阀官僚在势力上互相争夺，对皇权构成了威胁。
东晋时曾流传一句话叫“王与马，共天下”。“马”是指东晋开国皇帝晋元帝司马睿，“王”则指最为显赫的琅琊王氏代表人物王导。司马睿最初受封琅琊王时，得到王氏一族的鼎力支持。
西晋末年大乱时，王导一手策划司马睿称帝，东晋政权形成。而且司马睿在登基典礼上，王导与司马睿一同坐在龙椅上，于是“王与马，共天下”便成为民间传颂。
王导在东晋做到宰相，他历经晋元帝、晋明帝、晋成帝三代帝王，王导的家族势力也成为东晋重臣高官。据统治，东晋时，王氏一族出过8位皇后，王氏子弟与皇室公主联姻有二十多人。不仅如此，王导的堂兄王敦还掌握兵权，当时拥有江拨六镇军事重镇，还发生叛乱，差点灭掉东晋。另外，陈留谢氏，能与琅琊王氏比肩，当时流行一句古诗“山阴道上桂花初，王谢风流满晋书”，不得不说，王、谢两族成为晋朝门阀官僚世袭典型代表，使东晋官僚在两大姓氏传承，其他姓氏官僚地位高的寥寥可数，既阻碍了官僚体制的活力，使皇权受到严重削弱，又是东晋最后走向灭亡的一个重要因素。
晚清幕府的制度
“晚清幕府”并不是一个历史学名词，而是根据曾国藩、李鸿章等人身边聚集的幕僚及后期发展衍生出来的一种说法，被学者称为“晚清幕府”，严格来说并真正有“幕府”。这一约定成俗的官僚体系的形成，大的背景是太平天国运动，清朝政府赖以依仗的八旗制度已经落后，只得启用团练制度，允许南方汉官练兵用于自保，形成具有私人性质军队，也自然形成了围绕私人军队的大量私人幕僚人员，于是就形成了晚清幕府制度。
当时太平天国运动，以及鸦片战争失败后，西洋势力深入中国，一些地方有权势的官僚阶层，为了自保，便以以家人、亲戚、朋友等群体建立了势力网络，相互自保。像曾国藩训练的湘军便是这种群体形成的。
而真正支撑湘军运行的，是曾国藩身边的幕僚人员。这些人员并不是清朝官员，他们是投靠到曾国藩身边的参谋人员。有的是朋友之间推荐，有的是自荐，有的是曾国藩自己招募的。
因为曾国藩等人建立的地方军体系，不同于八旗军，军队内部也设立管钱、管物、管粮、管训练、管文书等大小小的机构，这些机构清朝并没有给予相应官职，只能让幕僚人员充当。
曾国藩身边的幕僚都由他发薪饷，或者曾国藩筹措银两给他们。这些幕僚都完全听命于曾国藩等人。因为太平天国运动的需要，清朝对于地方官员招募的幕僚也睁只眼闭只眼。清朝为了防止汉人官僚阶层势力坐大，规范约束了幕僚管理，但并不妨碍后期发展。曾国藩灭掉太平天国后，赶紧自裁军队和幕僚，但一些幕僚也大都通过他的举荐，受到了重用。曾国藩，李鸿章等人已经把幕僚运用炉火纯青的地步。
曾国藩在选用幕僚时，有自己的独到的眼光，无论军事、政治还是文人，他都重用专才之人。后人也对晚清幕僚制度进行了肯定。但在清朝环境里，这种制度只能是在乱世中体现出作用，乱世结束后便形成了一种官官相护的官僚势力阶层。很多人想升官或者进入官场，如果不进入这个幕僚阶层，很难提拔重用。
可以说，晚清的幕府制对于平定太平天国运动，为清朝续命做了贡献。因此很多学者研究清朝幕僚，这项制度并无高深莫测之处，实际上就是熟人连接熟人，也是一套官僚网络体系。
比如左宗棠曾是曾国藩的幕僚，他是陶澍所引荐。陶澍认为左宗棠是人才，“目为奇才，纵论古今，为留一宿。”
陶澍比左宗棠大了三十多岁，可以是两辈人，但陶澍认为左宗棠是人才，将来必定重用，认识十多天后就对左宗棠说：“若论年齿，但须渠夫妇年相若可矣，不须论亲家年齿也。君若论门第，此系贤女佳至吾家，无忧不适。至于名位，君他日必远胜于我，何忧为？”后来陶澍的儿子娶了左宗棠的长女。
而陶澍的女婿胡林翼与左宗棠也是老相识，是胡林翼发现了左宗棠，才使陶澍喜欢的不得了。太平天国运动时，在胡林翼的推荐下，左宗棠先到骆秉章府中当幕僚，后来转到曾国藩手下，其能力水平就被清朝所重视，而且在众多湘官的保荐下成为清朝官员。
同样曾国藩的大儿子曾纪泽聚的原配夫人，是曾国藩好友、湘军将领刘蓉的女儿。可见晚清时幕府体系，也逐渐在同乡、联姻体系下，使官僚网络越结越大。
两者不同结果同
魏晋时期的门阀官僚世袭制度的弊端，通过西晋、东晋两个王朝灭亡，便可以看出其不足之处。虽然晚清幕府体系比东晋门阀官僚制度有所改进，其先进性在于，选拔天下能人之士，不问出身，便可从幕僚做起，最后经过举荐而成为朝中重臣。看上去晚清幕府要比东晋门阀先进，但也有其弊端。
因为晚清幕府是在太平天国乱世中形成，必然带有军事性质。但在清朝体制下，这种幕府体系存在一时，但其影响却很长远，特别李鸿章的幕僚，一直伴随清朝灭亡。虽然不乏能臣，但幕僚体系成长起的官员，其主张必然受幕主影响，即使他们有先进思想，在幕主的影响下，也不可能“独树一帜”。再加上晚清体制落后，想改变一个王朝的命运，幕府制显然不是改革办法，是另一个封建官僚体系“变种”。想挽救大清根本不可能。
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