“康乾盛世”是中国封建历史上国力最后的一个巅峰，中国从经济、人口都得到了长足的发展，经济总量占世界经济总量的近40%。但是盛世伴随着硝烟战火，有这样一场战争跨越了清朝的中前期，从康熙二十七年（公元1688年）正式打响，一直到乾隆二十年（公元1758年）彻底剿灭才宣告结束，长达70年，这就是准噶尔之役。而雍正时期是清朝对抗准格尔的高潮。雍正前期，全力收复西藏和青海，青海贵族罗卜藏丹津的叛乱，给青海的和硕特蒙古部族带来了深重灾难，使得青海蒙古族人口从20多万锐减到8万，严重破坏了西北地区的社会安定和生产发展，雍正皇帝决心派最强打手年羹尧武力平叛罗卜藏丹津！

罗卜藏丹津叛乱在雍正二年被平定后，雍正帝采纳年羹尧的《青海善后事宜十三条》和《禁约青海十二事》，将青海蒙古部族置于清朝中央的严格控制下，对他们加剧推行分化与羁縻相结合的政策，下诏把青海和硕特蒙古族仿照内蒙古扎萨克制度分编为29旗。同时，清廷对青海蒙古各旗划定了游牧界限，使得他们不得互相统属，不得互相往来，逐步消弭各部落之间的联系，防止在出现叛乱的可能。

由于西藏、青海正式并入中央政府的管辖势力范围，使得清朝正式形成了对准噶尔部落南部、东南部的军事包围态势。此时，清朝正式拥有了打击准格尔部落更大的主动权。

雍正五年（1727），准噶尔汗王策妄阿喇布坦病死，他的儿子噶尔丹策零继承汗位，人称“小噶尔丹”。不过，这位准噶尔新汗，在开疆拓土方面，可比他的父亲策妄阿拉布坦和叔祖噶尔丹都厉害得多，让雍正、乾隆两代清朝皇帝坐卧不安。

噶尔丹策零刚刚继位，雍正帝此时已经打击了内部敌对势力，完全掌握了大全坐稳了帝位，就准备出兵征剿准噶尔。此时，大名鼎鼎的军机处正式登上了历史舞台，目的在于方便西北用兵的指挥工作。

雍正七年（1729），雍正帝派出吏部尚书傅尔丹为靖边大将军，率五万精锐进兵讨伐， 傅尔丹出身显赫，此前也战功赫赫。康熙五十九年（1720年），傅尔丹率领八千人自布拉罕进军到格尔额尔格，准噶尔的大军被击溃，傅尔丹击斩准兵二百余级，擒获 准噶尔”宰相“等百余人，全部收服了准噶尔的部众。又焚毁了乌兰呼济尔的准军粮草，随后引兵回师。为了此此次出征，雍正皇帝煞费苦心， 派出6000京师八旗、9000御林军、8000盛京八旗，同时，他任命岳钟琪为宁远大将军，从西路出师助战。

但是事与愿违，此次战役结果十分尴尬。雍正九年（公元1731年），准噶尔军队首先攻击吐鲁番地区，和清军展开了拉锯战。由于补给困难，准格尔不与清军硬碰硬，专打补给线。清军只能被动挨打。

准格尔为了乘胜追击准备攻击清军北路军，使用反间计，派出塔苏尔海丹巴为间谍，故意让守卡清军捕获。被审讯之时，塔苏尔海丹巴诈称说：噶尔丹策零发兵3万，由大策零敦多卜、小策零敦多卜分别率领，来犯清军北路。如今，小策零敦多卜已到达察罕哈达，而大策零敦多卜因故逗留未至。

傅尔丹信以为真，就决定乘准噶尔大军未集中之时，先发制人。于是，他选兵万人，循科布多河西以进。其中，清将素图、岱豪为前锋，定寿等人领第一队，马尔萨等人领第二队，傅尔丹率大兵继后而进。而回，傅尔丹令衮泰率领小部分兵士留守护城，陈泰屯于科布多河东，保护饷道。六月开始，清军屡次与准格尔接战不利，军心更是浮动。傅尔丹率军在进入博克托岭被准格尔伏兵伏击，损失惨重。因此傅尔丹决定向和通泊边突围。

六月二十三日，准噶尔军乘胜，进而包围了在和通泊边水草地集结的清军大营。此时此刻，作为统帅的傅尔丹也只得咬紧牙关，亲自督兵抵御，杀叛军500多人。当时，高树红色大纛的科尔沁蒙古兵被准噶尔兵围攻，而高树白色大纛的土默特蒙古兵在沙津达赖指挥下，前往阵中，奋力拚杀救援自己的同胞。可惜，当时清军胆寒，他们望见土默特蒙古兵的白纛在敌阵晃动，就误认为土默特蒙古兵也被准噶尔军队围歼了，登时大溃！

兵败如山倒，清军最终一败涂地。傅尔丹只得指挥残余兵士突围。当七月一日清军退回科布多时，傅尔丹手下仅剩下两千人。五万大军被杀殆尽，这是清朝和准噶尔战争中清军损失最严重的一次大败！

终雍正皇帝一朝，也没有剿灭准格尔，雍正13年，清准签订合约，双方以杭爱山为界，以东归大清，以西归准噶尔，此后相安无事大约20年。乾隆皇帝闻此大败，终奋发图强，1757年，清军发起最后一次决定性战役，准噶尔汗国的军事力量被彻底摧毁。