清朝皇子不能让亲生生母抚养的原因，是清朝祖制，清朝建国之初就有皇子、公主生养、教育的规定，但到康熙皇帝时才确立为正规的制度，称为祖制，直至清朝灭亡都严格遵守这个制度。

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第一、这么做，其实是为了提高皇子的地位。清朝规定，只有嫔以上的女性才能抚养皇子皇女，但是任何人都不能抚养自己的亲生子女，在自己孩子出生后不久，他就要离开生母，被别的人抚养长大，只有在生母生日或者是一些重大节日才能见上一面。

第二、源于满人崇尚勇武的本性，将皇子与生母分开，是要防止皇子被溺爱，继而保持满清坚忍勇武的性格。

第三、是为了培养皇子的独立性，离开生母成长的皇子，往往都不会十分娇气，能够尽快的自立，这样也有助于皇子能够一心学习治国之道。

第四、与政治有关，主要为了防止外戚专权。皇子自幼离开生母，由养母抚养长大，这样做之后，皇子被确立为皇位继承人后，一般就不会重用生母亲族，引发外戚专权。

第五、也是最有人情味的一个原因，是为了照顾一些没有生育能力的妃嫔；所以才会过继子女让她抚养。