与C3植物相比,C4植物的光合特征是低光呼吸、高光合效率并伴随着水氮利用效率的提升。C4植物一般生长在温带或热带气候及高光辐射地区,并且C4光合在禾本科植物中普遍存在。C4光合性状的进化涉及到束鞘细胞(bundle sheath cells,BSC)的功能特化以及光合和光呼吸过程中关键酶的重新定位和分子适应。该适应性进化过程涉及到基因重复、新功能化、以及现有基因产物的表达和生化特性的变化【1,2】,但是许多关键的进化细节仍不清楚。
最大的C4植物生化亚型,包括主要的单子叶作物玉米和高粱,通过C4-NADP-ME(C4-specific isoform of nicotinamide adenine dinucleotide phosphate- dependent malic enzyme)在BSC叶绿体中脱羧苹果酸盐,以有效地将CO2递送至Rubisco酶进行光合作用【3】。由于C4-NADP-ME脱羧和Rubisco羧化速率的协调对C4途径有效通量的重要性,对该酶的动力学优化及严格调控至关重要。值得注意的是,质体的C4-和非C4-NADP-ME的动力学及调控特性不同:玉米和高粱中C4-NADP-ME的催化效率比非C4-异构体高2到5倍并且C4-NADP-ME对苹果酸盐的亲和力高2倍;C4-NADP-ME在pH 7.0时被苹果酸盐抑制;此外,C4-NADP-ME为四聚体而非C4-异构体为二聚体【4,5】。但是关于C4-NADP-ME进化的分子调节机制尚不明确。
近日,Nature Plants发表了一篇题为Molecular adaptations of NADP-malic enzyme for its function in C4 photosynthesis in grasses的研究论文,阐明了C4-NADP-ME在禾本科C4光合进化过程中的分子适应机制。
该研究开发了一种算法,用来检测质体光合和非光合异构体中严格差异保守的氨基酸(20种),并结合玉米和高粱C4-NADP-ME的晶体结构,筛选了对C4进化十分重要的功能性氨基酸(F140,N142,N159,T163,R201,E339,P433,Q503和L544)。并且它们可能1)影响底物/辅因子结合或催化的位点;2)参与二聚体或四聚体形成;或者3)是推定的异构苹果酸抑制位点的一部分。该研究进一步通过定点诱变和结构分析发现:Q503,L544和E339参与催化效率;并且 E339有助于苹果酸的pH依赖性调节;F140对于寡聚结构的稳定至关重要;并且N-末端区域参与四聚化。
通过玉米和高粱C4-NADP-ME的晶体结构鉴定出的功能性候选氨基酸
总之,该研究揭示了C4-NADP-ME进化过程中的分子适应机制,并为C4代谢关键生化步骤的有效催化和调节的研究提供了基础。
参考文献
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