当你穿着蓝色制服，戴着哔哔小子，背负着避难所里乡亲们给予的任务，行走在广阔的废土大地，顺手解决了几个掠夺者与变异小怪，正做着拯救废土的英雄梦时，迎面就遇上了几个面目狰狞的绿皮大汉……
当他们不由分说、哇哇爆叫地朝你冲过来时，你才体会到让废土居民谈之色变的超级变种人有多可怕。
在美国废土上，有着一种身材高大、体型壮硕的类人型生物，他们大多有着绿色皮肤，身高大约10.5英尺（3.2米），体重超过800磅（约363公斤），强悍又野蛮。
这种生物很像从奇幻世界中穿越而来的兽人，但他们在废土上被称为超级变种人。很多玩家在第一次面对他们时，都会被其强大的战斗力与无畏的战斗风格所震撼。
这些生物的战斗力与强悍的外表一致，加特林机枪、火箭发射器等重武器在他们手中运用自如，常人难以挥动的冷兵器也在他们手中被耍的呼呼挂风。
粗糙的皮肤与坚硬的骨骼让小口径武器很难对其造成致命伤害，超强的自愈能力更是让他们在战斗中悍不畏死。当他门三五成群向人类袭来时，就算是身着动力装甲的战士，也很难全身而退。
短期的辐射即可能造成恶性病变，一生都暴露在辐射尘中，则可能导致一些难以预料的结果，甚至DNA也会发生变异，这也是废土上有大量变异生物的原因。但超级变种人并非辐射的产物，而是人工基因改造所结出的恶果……
超级变种人虽然在核大战后才出现在废土上，但他们的起源可追溯至战前。美国在与天朝的能源战争期间，开展了诸多试验项目，除了研发能量武器与动力装甲外，更有一些反人类的计划被秘密实行。
以打造超级战士为目的，名为FEV病毒的基因武器研发项目便是其中之一。
泛免疫病毒计划
在2073年，随着能源战争的愈演愈烈，生化武器被投入了战场，美国政府为寻找对策，在加州的西部科技研究所开展了：泛免疫病毒计划（Pan Immunity Virion Project，简称PVP）的相关实验。
本计划为刺激人体免疫系统，使其可以自然抵消生物制剂，实验结果确定受试者的DNA由双螺旋结构转变为四螺旋结构，让受试者变得几乎对任何已知的人工病原体免疫。
美国政府于2075年8月在阿帕拉契分部开展了“温室行动”计划，此计划试图利用PVP来突变植物，从而达到增加粮食产量的目的，解决因粮食短缺造成的全国性暴乱。
强制进化病毒诞生
经过长期研究后，科学家们于2075年的PVP第10-011号实验中有了新的发现。此次实验成功地让病毒在单细胞生物身上觉醒，泛免疫病毒（Pan Immunity Virion）被重新命名为强制进化病毒（Forced Evolutionary Virus，简称FEV）。
后续的实验得出结果，受试生物体型变大，智力得到加强，性格也发生了变化。让研究人员十分吃惊的是，他们从没想到FEV病毒会让受试生物变得凶猛好斗。
2076年为了监管这个关乎国家利益的实验，美国政府将罗伯特·史宾德上校的部队派往了西部科技研究中心，罗杰·麦克森上尉（钢铁兄弟会长老约翰·麦克森的祖父）也在此部队中。
人体实验
随着实验的深入进行，军方研究员不再满足仅让士兵获得生化武器免疫力，而是希望借由FEV病毒能强化生物的特性，制造出强壮又聪明的超级士兵，以便击溃天朝数倍于己的兵力。
当FEV病毒在动物身上的实验达到预期效果后，美国军方将FEV研究设备迁至加利福尼亚的马里波萨军事基地，随后开始对军事监狱里的囚犯进行了罪恶的人体实验。
研究人员发现，FEV会让受试者获得几乎完美的DNA，DNA中所有能够导致疾病产生的隐性基因全部被剔除，RNA（核糖核酸）的转录速度变得更快，使得他们不会生病、对辐射免疫且有着超强的回复能力，身体会变得异常高大强壮，力量与速度更是远超常人。
但FEV病毒作用在人类身上的效果并没有预期的理想，受试者受到的负面影响同样十分可怕，不论男女在感染了FEV病毒后，均会失去生育能力，最终稳定在一个无性别的状态，转变为一个“光头大汉”。他们大多数会在转变过程中失去自己的记忆，智力水平也会受到影响。
马里波萨叛乱
正当研究人员不断尝试改进FEV病毒时，罗杰·麦克森上尉和他的部下发现了基地内的罪恶研究，罗伯特上校也因此事而精神崩溃，不久便自杀了。
麦克森代替罗伯特掌握了大权，经过审讯后处死了首席科学家罗伯特·安德森。并通过无线电宣称自己和其部下脱离美国政府控制，但并未收到任何回复。几天后基地里响起了防空警报……
2077年10月23日，核战的爆发摧毁了美国，马里波萨军事基地幸存了下来，士兵和家属们在基地内躲过了致命的辐射，但基地内的一部分FEV病毒却不知什么原因被释放到了外界。
缓缓落下的辐射尘堙没了人类文明，也暂时掩盖了美政府的种种恶行，世界回归了平静。残存的人类每天都在艰难求生，为填饱肚皮不断奔波，他们丝毫没有察觉，废土之下那凶险的暗流正不断涌动。“潘多拉的魔盒”即将重新开启……
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