对于每个从事分子生物学和生物化学研究的实验狗,基本上离不开分子克隆、引物设计等。下面小编为你整理了八款序列比对分析软件。
1. 综合性蛋白核酸分析工具包
Vector NTI Advance 11.5.2 Demo
具有蛋白核酸序列分析、引物设计分析、序列显示、多序列排队比较、序列装配等多种功能,还具有增强Internet功能,可直接在软件中使用互联网相关网站的生物信息功能。DEMO版只能分析给定的数据。
https://www.thermofisher.com/hk/en/home/life-science/cloning/vector-nti-software.html
2. 生物信息学综合软件
CLC Sequence Viewer 7.5
可提供一些基本的限制酶位点分析、比对、进化树分析、不同格式文件转换等功能。
http://www.qiagenbioinformatics.com/productdownloads/
3. 序列综合分析软件
Geneious 8.0.3
是基因组学和蛋白组学综合研究工具软件,该软件为分子生物学研究人员提供了蛋白、基因序列分析、显示、文献检索、序列比对、进化树分析、ORFs查找、引物设计等多种分析功能。
https://www.geneious.com/
4. 对核酸与蛋白序列进行多序列比对的软件
Clustal W 2.1
用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助,Clustal W很适合这些方面的要求。
https://www.genome.jp/tools-bin/clustalw
5. 生物分子序列编辑与分析软件
SeqPup 0.9
功能包括多序列比对、单序列编辑、各种序列格式文件读取与将序列输入到不同的序列格式文件、序列整理打印(可加框与阴影,加标记等)、序列编辑、互补序列、DNA翻译到蛋白质序列或蛋白质序列翻译到DNA。它还可以外挂其他分析软件,例如ClustalW等,可自己定义外观应用软件。目前的版本用Java语言写成,需要Java运行环境。
http://iubio.bio.indiana.edu/soft/molbio/seqpup/
6. 序列编辑器与分析工具软件
BioEdit 7.2.1
BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件,功能非常强大,使用十分容易。功能包括:序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制。
http://www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html
7. 用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件
PhyloGrapher
根据给定的基因,生成定制的图形。 需安装TCL/TK才能运行。
http://www.atgc.org/PhyloGrapher/PhyloDownload.html
8. DNA和蛋白序列编辑管理软件
GENtle 1.9.4
DNA和蛋白序列编辑管理,数据库管理、质粒图、比对、凝胶分析。
http://gentle.magnusmanske.de/
本期就介绍到这里。这么好的东西,快分享给朋友吧!
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