准噶尔汗国以前是蒙古族一个游牧部落，1635年归顺清朝，从1670年噶尔丹夺取汗位后，开始对抗清廷，国土面积曾扩大到700万平方公里，到1758年乾隆剿灭准噶尔汗国，准噶尔汗国对抗清朝近90年之久。

图为17世纪末准噶尔汗国形势图。
首先准噶尔部与中亚哈萨克部、西伯利亚部关系紧密，与西藏喇嘛地区关系良好，特别是与沙俄的友好合作，长期冲淡与中原的联系，贬低清朝的关系，种种外交因素促成了准噶尔部叛乱清廷，建立一个独立蒙古国的思想。到后来准噶尔和清政府的战争演变成：清政府侵略准噶尔领土，沙俄是准噶尔的天使，准噶尔为了民族解放和独立进行的正义的战争。

图为今天的新疆和布县有准噶尔汗国的城堡遗址。
当年元朝灭亡后，蒙古贵族跑到漠北建立政权，后来逐渐归顺明朝，其中一部叫瓦刺于1408年归顺明朝，瓦刺首领马哈木封王，这里的瓦刺就是后来的准噶尔部，1451年瓦刺部也一度自称天圣可汗，与明朝斗争试图恢复元朝江山，战败后向西发展并与突厥、回纥、蒙古其它部长期活动。

噶尔丹想利用沙俄恢复蒙古国，最后自己成为沙俄和清廷的筹码，终被沙俄抛弃。
1635年，漠南蒙古推举皇太极为蒙古大汗，不久漠北蒙古也上贡宝马称臣，准噶尔部也获得金册和金印，虽然一度准噶尔和清廷保持着隶属关系，但噶尔丹即位后开始发生叛乱，比如1695年噶尔丹被清军击溃后，西藏五世喇嘛请求不要惩罚噶尔丹。

图为新疆伊犁将军府。
在准噶尔汗国数次叛乱中，都有沙俄的身影，长期以来沙俄都向准噶尔汗国派出特使，多次叛乱都有沙俄兵作乱，特别是1691年沙俄曾派6万鸟枪兵，助噶尔丹内侵。准噶尔叛军被清军击败后均往西北逃窜，无法斩草除根，屡次死灰复燃，清廷的短视也并未对平叛后的准噶尔进行管理，直到1762年乾隆才在西北设置伊犁将军，此后西北无大战事，一旦有风吹草动都能迅速剿灭。