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沈阳医学院建有市政府特邀院士工作站，是全国示范院士专家工作站、辽宁省示范院士专家工作站、沈阳市先进院士专家工作站。建有诺贝尔生理学或医学奖获得者斐里德·穆拉德工作站。环境污染与微生态实验室、手外科组织工程实验室、行为与认知神经科学实验室、过敏性疾病过敏原致病机制研究实验室为辽宁省重点实验室；环境与人口健康实验室为辽宁省高校重点实验室；心血管病实验室、脑老化与认知神经科学实验室、食品安全与风险评价研究实验室、手外科组织工程实验室、环境与人口健康实验室、环境污染与微生态实验室、慢病评估与健康干预实验室、肾脏钙化疾病防治实验室为沈阳市重点实验室；医学生物技术工程中心为沈阳市工程中心；人体科学展览馆为省、市科普基地。