肿瘤是目前对人类健康威胁最大的疾病之一,全面认识肿瘤发生发展机制,将有助于开发针对性检测与治疗策略,阻断肿瘤发展和转移。因此,今天检验君为大家带来的是中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授团队关于肿瘤发生发展机制与检测靶点研究前沿。
肠道微生物相关代谢物在检测结直肠癌和腺瘤中的作用
结直肠癌(CRC)已成为世界范围内日益严峻的健康挑战,其发病率和病死率近年来明显升高,多数患者在确诊时已属于中晚期,严重威胁患者的生存及生活质量。因此,亟需开发一种无创可靠的CRC检测方法。
近日,中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授课题组建立了一个基于肠道微生物组相关代谢物的结直肠癌检测模型(GMSM),可用于鉴别结直肠癌和腺瘤患者与健康人群。该研究发表在《Gut》。
该研究通过液相色谱-质谱法和配对粪便样本的宏基因组测序对非靶向血清代谢组学进行多组学整合分析,发现并初步鉴定了CRC和腺瘤患者中丰度显著改变的肠道菌群的相关代谢物。通过靶向代谢组学分析检测这些代谢物区分CRC和结直肠腺瘤的能力,在独立的验证队列中建立并评估了基于肠道微生物组相关代谢物用于诊断结直肠癌的诊断模型。
结果发现,共有885种血清代谢物在大肠癌和腺瘤中发生了改变,其中8种肠道微生物相关血清代谢物,通过靶向和非靶向代谢组学分析可重复检测,并能够准确区分大肠癌和腺瘤与正常样本。基于这8种代谢物建立的肠道菌群相关代谢物的模型(GMSM panel)可以用于检测结直肠癌和腺瘤。在建模队列中,曲线下面积(AUC)为0.98(95%CI0.94至1.00),在验证队列中,AUC为0.92,灵敏度为83.5%,特异度为84.9%。而且,GMSM模型明显优于目前临床临床广泛使用的结直肠癌标记物癌胚抗原(CEA),对腺瘤和早期大肠癌的诊断具有较高的准确率。
总之,该研究通过多组学分析建立了CRC和腺瘤检测模型,通过整合对正常人群和CRC人群的粪便宏基因组和血清代谢组的分析,发现结直肠癌和腺瘤与血清代谢组之间存在关联,从而建立了一个基于外周血代谢组学的高精度CRC与腺瘤的检测模型。
文章链接:
https://gut.bmj.com/content/early/2021/08/29/gutjnl-2020-323476
HRNPA2B1通过调节miR-17-92簇影响食管癌预后
食管癌(ESCA)是一种常见的消化系统疾病,由于早期隐匿的临床症状和缺乏有效治疗,大多数ESCA患者确诊即为晚期,预后不佳、病死率高。因此,更好地了解ESCA发生和发展的机制,将有助于更有效地治疗ESCA患者。
近日,中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授课题组的一项研究表明RNA结合异质核蛋白A2/B1(HNRNPA2B1)可通过调节miR-17-92簇影响食管癌预后,并探讨了其具体影响机制。该研究发表在《Frontiersin Cell and Developmental Biology》。
该研究首先以TCGA数据集为测试集,分析了159个ESCA和10个正常食管组织中25m6A调节因子的表达谱。发现几乎所有的m6A调节剂在ESCA组织中都比正常组织显著升高,HNRNPA2B1在食管组织中表达量最高。为了进一步了解m6A调节因子在ESCA中的预后价值,研究人员应用单因素Cox比例风险回归模型对潜在基因进行筛选,结果表明m6A调节因子在影响ESCA患者的预后中发挥重要作用。
随后,研究人员探讨了ESCA患者的危险评分与临床病理特征之间的关系,发现基于HNRNPA2B1、HNRNPG和ALKBH5的预后评分模型可以预测ESCA患者的预后。HNRNPA2B1可通过调节ESCA中miR-17-92簇的表达参与肿瘤进展,高表达HNRNPA2B1的ESCA患者预后较差,敲除HNRNPA2B1可降低ESCA细胞系miRNAs表达及抑制细胞增殖。
总之,HNRNPA2B1的高表达提示ESCA患者预后不佳,并与远处转移和淋巴结分期呈正相关。敲除HNRNPA2B1可降低miR-17、miR-18a、miR-20a、miR-93和miR-106b的表达水平,并抑制ESCA细胞的增殖。
文章链接:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2021.658642/full
血清KLKB1可作为潜在的肝癌预后生物标志物
由于微创手术和介入治疗在肝细胞癌(HCC)中的广泛应用,组织越来越不易获取,以及获取的组织不足以进行检测等问题,筛选血液标志物对预后评估具有重要意义,也是患者合理选择最佳的个体化治疗的重要方向。
监测HCC复发和转移,临床常用血清甲胎蛋白抗原(AFP),然而,30%至40%的HCC可能表现为AFP阴性。因此,寻找新的HCC预后非侵入性生物标志十分有必要。
近日,中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授的一项研究表明,基于数据独立采集(DIA)和平行反应监测(PRM)协同分析,血清KLKB1可作为潜在的肝癌预后生物标志物。该研究将发表在《Journa lof Hepatocellular Carcinoma》。
研究人员通过数据独立采集(DIA)筛选不同预后的HCC患者血清中潜在的标志物,并采用平行反应监测(PRM)进一步确定有价值的预后标志。而后使用酶联免疫吸附试验(ELISA)对205例HCC患者、32例健康人和35例肝硬化患者的血清中候选分子标志进行了分析,并在癌症基因组图谱(TCGA)HCC队列中进行了验证。
首先通过DIA技术在预后不良组(总生存<1.5年,24例)和预后良好组(总生存≥5年,24例)中筛选出86个差异显著的蛋白。继而由PRM技术对8种DIA蛋白组学分析的蛋白进行了定量分析,其中6种蛋白(KLKB1、IGFBP3、SHBG、SAA1、C7和CD44)在DIA和PRM之间表达趋势一致。
ELISA结果显示,HCC患者KLKB1水平与健康人和肝硬化患者有明显差异。治疗前后血清KLKB1水平也有显著变化(P= 0.016)。血清KLKB1水平较高的患者总生存期(P= 0.035)和无进展生存期(P=0.027)明显优于KLKB1表达较低的患者。在TCGA-HCC队列中,Cox回归分析提示KLKB1是肝癌患者总生存期的独立预后因素(P= 0.032)。蛋白质和mRNA数据都表明,KLKB1的异常表达与HCC患者的预后密切相关,这些发现可能对预测HCC的预后有意义。
建立DIA/PRM/ELISA工作流程可用于发现和验证血液中的蛋白质标志,有助于预后评估。此实验的设计开辟了一种新的思维方式,和以往的组织芯片不同,这种“从血清到血清”的方法避免了组织的异质性。研究人员表示,该实验虽然研究对象是肝癌,但此方法也适合研究其他疾病。
兼具异质表型和上皮型的上皮循环肿瘤细胞与NSCLC转移相关
非小细胞肺癌(NSCLC)占肺癌的85%,由于NSCLC的侵袭性较高,导致我国70%患者确诊时已是晚期,而早期治疗患者的5年复发和转移率约为20%。因此,为了改善NSCLC的治疗,必须了解其发病机制。
近日,中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授课题组的一项研究表明,兼具混合上皮/间充质表型(E/M)和上皮型(E-CTCs)循环肿瘤细胞与初诊NSCLC患者远处转移相关。该研究发表在《Journal of Cancer Research and Clinical Oncology》。
该研究纳入了82例平均年龄为59岁的NSCLC患者,其中60例未接受任何治疗,22例接受了放射治疗或靶向治疗。采用Canpatrol™技术富集5mL静脉血中的CTCs,然后结合上皮型标记物(EpCAM和CK8/18/19)和间质型标记物(波形蛋白和Twist1)进行RNA原位杂交。
根据荧光斑点信号不同将CTCs分为上皮型CTCs(E-CTCs)、间质型CTCs(M-CTCs)和E/M-CTCs。混合E/M-CTCs进一步分为三个亚型,即E>mCTCs、e=mCTCs和e
每5mL血液中总CTC、E/M表型CTCs、E-CTCs和M-CTCs的中位数分别为22个/5ml(1-90个/5ml)、13个/5ml(0-83个/5ml)、1个/5ml(0-17个/5ml和0-47个/5ml)。回顾性的分析60例初诊患者的临床数据,发现首诊患者中混合型E/M-CTCs在肿瘤转移患者与无转移患者之间存在统计学意义。晚期NSCLC患者的M-CTCs明显多于早期患者,ROC曲线显示,以2个细胞/5mL血为临界值,诊断晚期NSCLC患者M-CTCs的敏感性为58.62%,特异性为77.42%。单纯混合型E/M-CTCs患者远处转移阳性组的占比低于阴性组(7%vs22%),而E+E/MCTCs组(20%vs9%)和E/M+MCTCs组(33%vs20%)的占比较高。
总之,该研究表明NSCLC患者外周血中存在异质性CTCs,兼具有E/M-CTCS表型和上皮型循环肿瘤细胞与患者远处转移有关。研究人员表示,CTC模式及其临床解释仍需进一步研究。
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https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00432-021-03681-9
YTHDF1可能是KRAS/TP53共突变肺腺癌的潜在治疗靶点
KRAS和TP53突变是肺腺癌(LUAD)患者最常见的两种突变方式,当KRAS和TP53共突变(KRAS/TP53-mut)发生时,降低了潜伏期,增加了转移倾向,然而所涉及的分子机制尚不清楚。
日前,中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授课题组的一项研究表明,YTHDF1通过m6A调节促进细胞周期蛋白B1的翻译,并导致KRAS/TP53-mutLUAD患者的不良预后。该研究发表在《Cells》。
该演技首先分析了TCPA数据库中237种蛋白的表达情况,结果表明,KRAS/TP53-mut组细胞周期蛋白B1在蛋白水平和翻译效率上均有上调。KRAS/TP53-mut组细胞周期的通路活性明显高于野生型组。KRAS/TP53-mut组上调的通路与重要的生理功能有关,而KRAS/TP53-mut组下调的通路则在代谢中富集,表明组内存在代谢紊乱。
此外,还观察到YTHDF1在KRAS和TP53突变细胞中的表达增加,YTHDF1下调在体外可抑制肺癌的生长。YTHDF1可以通过促进CCNB1的体外翻译来调节KRAS/TP53-mut肺癌细胞的增殖能力,提示YTHDF1的表达与CCNB1的表达有关,可能导致KRAS/TP53-mut肺癌患者预后不良。
总之,该研究发现,YTHDF1的表达增强与KRAS/TP53-mut的LUAD患者低生存率相关。YTHDF1以m6A依赖的方式控制CCNB1的翻译,并促进KRAS/TP53-mutLUAD的增殖。研究人员表示,YTHDF1可能是KRAS/TP53-mutLUAD的潜在治疗靶点。
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https://www.mdpi.com/2073-4409/10/7/1669/htm
我国帕金森病患者端粒加速缩短与LRRK2变异无关
帕金森病(PD)是常见的神经退行性疾病,影响到约2%的60岁以上人口,面对日益增多的PD患者带来的社会和经济负担,揭示PD基因生物学和开展神经保护干预至关重要。
日前,中国医学科学院肿瘤医院崔巍教授课题组的一项研究表明,PD患者的白细胞端粒长度(LTL)缩短显著增加了患PD的风险,与LRRK2变异无关,并证明G2385R是PD易感性增高的危险因素。该研究发表在《AGING》。
该研究从北京协和医院随机招募了261名PD患者(127名女性,134名男性),以及270名性别和年龄相匹配的健康对照者(122名女性,148名男性)。研究发现,PD患者白细胞端粒长度LTL明显短于对照组。采用年龄和性别调整的Logistic回归分析调查了PD与生化指标之间的关系,这些参数在两组之间存在显著差异。较高的总蛋白、白蛋白、总胆固醇、HDL-C和LDL-C与帕金森病风险降低相关,更短的LTL与帕金森病风险增加相关。
在六个亚洲流行的PDLRRK2变异体中,该研究没有检测到R1441C/G/H、G2019S和I2020T变异体,表明它们可能不是我国人群中常见的致病性SNPs,PD患者携带变异G2385R的频率高于对照组,然而在变异体R1398H的患病率方面没有发现显著差异。
该研究中,在所有参与者和对照组中发现年龄和端粒缩短之间有很强的相关性,但在帕金森病组中没有,这反映了年龄以外可能存在其他参与端粒调节的机制,或者一些混杂因素,如帕金森病患者的突变状态、疾病持续时间和其他生物标志物等。
总之,这是首次研究PD患者端粒缩短和LRRK2变异之间的关系,并表明更短的LTL与显著增加的帕金森病风险相关,G2385R是我国人群中与PD易感性增加的危险因素,但LRRK2变异与端粒长度之间没有关联。
文章链接:
https://www.aging-us.com/article/103878/text
●专家简介●
崔巍教授
中国医学科学院肿瘤医院检验科主任,研究员,博士研究生导师。专业为临床基础检验血液检验,分子生物学检验。现任中华医学会检验分会副主任委员,中华检验医学杂志副总编辑,北京医师协会检验医师(技师)专业委员会会长,国际实验血液学学会细胞分析和流式委员会委员(ISLH Cellular Analysis & Flow Cytometry Committee),IFCC EMD 临床实验室管理委员会通讯委员等。
第 111 期前沿报道到此结束
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编辑:唐强虎 审校:方琪
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