土壤结构是指最终土壤颗粒（即粘土、淤泥和沙子）的排列方式并结合在一起，称为聚集体或 peds。钙的可交换阳离子可以在称为絮凝的过程中引发这些颗粒的聚集。
絮凝的发生是因为钙离子的两个正电荷可以附着到两个单独的带负电荷的粘土矿物颗粒或有机胶体表面。这与铝的情况类似。这些阳离子有效地中和了负表面电荷。 然而，单独的絮凝过程并不能使聚集体稳定。各种土壤稳定剂也是颗粒聚集所必需的。
这包括粘土矿物、倍半氧化物（即铝和铁的氧化物）和腐殖质的存在。在第一种情况下，带负电的粘土矿物表面可以彼此相互作用并与沙子和粉砂大小的颗粒相互作用以形成聚集体。
此外，铁的氧化物也连接粒子，因为有些氧化物带有正电荷，而其他氧化物不带电荷，但可以形成连接粒子的坚韧涂层。
最后，大的有机分子倾向于在矿物颗粒之间形成桥梁，要么带有静电荷，要么像网一样将颗粒连接在一起。土壤微生物提供了最好的水泥，因为当它们分解土壤残留物时，它们会产生将 peds 粘在一起的树胶。
这些稳定剂以及由 土壤润湿、干燥、收缩和膨胀的重复循环导致的局部压缩过程以及生物（植物群和动物群）的作用导致同一土壤块的重复压缩。这导致难以拉开的聚集体（peds）的一致性增加。
结果是聚集良好的土壤，在聚集的土壤颗粒之间包含大的裂缝或空隙。这些较大的空隙或大孔改善了水渗透、气体交换和根部渗透。

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