明代宗朱祁钰没能葬在十三陵主要是因为和其哥哥明英宗朱祁镇结有私仇。

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1.在史称土木堡之变中，大明精英全军覆没，朱祁镇被俘获。明代面灭亡的风险。紧要关头，于谦排除众义，和清朝官员立朱祁镇的小弟朱祁钰为皇上，并引领了北京保卫战，使大明化险为夷。朱祁钰就无法自拔，赖着皇位先不说，当时约定的立哥哥的儿子为皇太子也不作数了，而是立自己的孩子为皇太子。

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2.朱祁镇被俘虏多年以后，竟然安然无恙地回家了。天不可以有二日，国不可以有二君，朱祁钰把他软禁了七年，万般凌虐。之后，于是朱祁镇和支持他的重臣启动了夺门之变，再次抢回皇位。

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因而他对朱祁钰痛恨之极，为什么会认这一皇上？派人将朱祁钰早已修完的帝陵端掉，并禁止他葬在明陵中，而是以王的身份，葬在了玉泉山。因此朱祁钰就未能葬在十三陵。