明清时的崇文门，具有极为重要的经济地位。明代大运河终点由城内的积水潭改为通州，进京客旅经运河北上，一般在通州上岸之后经朝阳门外大道，再由崇文门进城。

基于崇文门的交通枢纽地位，明清时期均在此设有税关，这里也成为仕宦往来、商旅流通的重要节点。

崇文门不仅仅是一座城门，对于所有外地来京人员而言，顺利通过崇文门税关的查验，是决定能否真正进入北京城的关键。崇文门作为京城东南大门，是进京的重要通道。

明代，由户部主管全国的财政，举凡财政预算、收支以及户口、税收等事直，均归其管辖。

户部设有13个清吏司，分管各省的财政和赋税，各司下设民、度、金、仓四科，其中金科是主管各项杂赋的机构，下设宣谏司，税课司。崇文门宣课司为其一，它的官员设置变化经历了以下几种:

一、大使

根据《明史》记载，各宣课司初期的职能长官，为大使，从九品，多由中央派儒者充任，下设攒典一人，巡栏八人。其俸禄，根据明朝记载，从九品官职岁禄六十石，俸钞三十贯，后虽有变动，但差距不大。

二、佐贰官

大使的职官管理模式延续到成化年间。

此后，宣课司改为地方官管理。崇文门税关为顺天府委派佐贰官一员监收商税。顺天府是京师地区的重要看门，顺天府尹以府丞，通判，治中等佐贰官辅佐，佐贰官为从六品，岁禄一百一十石，俸钞九十贯。

三、户部主事

弘治元年，崇文门税关重归户部手里，派御史和主事官员各一名征收商税。

由于崇文门所处的特殊的位置，其主事官任期“止于三月”，不同于其他钞关的一年一更”，方便官府对其控制，这种按季轮差方式一直到万历32年。其官员，一般属正六品，岁禄一百二十石，俸钞九十贯。

清代关税体系基本承袭明代。据康熙《大清会典》记载，崇文门作为中央设于京城的总税关，于顺治二年（公元1645年）开始征税。

同时，还在往来京城的重要关口设立了多处分税口，如卢沟桥、海淀、板桥、东坝等地。

清朝，崇文门税关的地位十分显著，成为首都重要的税务总局，且直接服从和服务于皇室，内务府开始控制重要官职，成为崇文门税关直接管理。关于具体官职，也历经变化。

一、顺天府治中

顺治时，崇文门由户部司员督理。康熙五年，又将各税关交与地方官，崇文门归属顺天府治中管理。

顺天府治中为顺天府尹的重要佐官，辅佐府尹办理内外各项事务，主管钱粮、户籍、田地等事，为正五品，年俸为80两，禄米80斛，养廉2400两。

二、户部满司官、内务府司官

康熙七年，崇文门税关恢复中央管理，户部和内务府对崇文门税务的管理模式开始形成。崇文门税关设正、副监督各一人，任期一年。监督下设有奏派正、副委员各一人，堂委、帮办委员两人，组成“务上”(税关总机关)，决定税关的一切事情。为了对其进行监督，朝廷还派有相史二人，专司稽查。

崇文门监督是一个权力很大的税官，其官员待遇自然也是十分丰厚，当时有人戏称“生不愿封万户侯，但应一管崇文门”。彼时“视此差遂为京官最优者”。乾隆时期，大臣和珅也当过崇文门税务主管。

清代的素彝曾在《通成以来朝野杂记》一书中写道:“余充素文门税关帮办委员，岁约可得四五千全..繼督岁入办不过数万金”。从这可以看出其待遇之雄厚，非其他官员可比拟。

民国初年，崇文门税关隶属财政部，崇文门税务总局的地位，不复存在。历次改名，北京商税征收总局、京师税务公署。北京税务监督公署等，最终被撤销。

至于其官员设置，大体可分为中央财政部和地方所属两种，官吏级别比报清代有所降低，待遇也无从考证。

从一座门，到一座城，崇文门是元明清以来北京城市发展最直接的见证。对内标识着京城的空间秩序，对外则是人员交往的重要通道；它更是一座经济之门，各地货物的流通汇聚，打造出一个全国最大的消费中心。

经历了明清的辉煌，崇文门税关在清代末期风雨飘摇。

民国成立后，崇文门税关隶属于财政部，改称北京商税征收总局

1930年10月，南京国民政府财政部电令：“永远废止五外常关”

（通商口岸五十里内归海关管理者为“五内常关”，五十里外不归海关管理者为“五外常关”）。

至此，历经500余年的崇文门税关走向终结。