【疑难案例讨论】

平衡染色体重排的高通量测序

春雨淅沥沥,新风拂叶青。

医学遗传中心每周五的疑难病例讨论会如约而至,这次由细胞遗传组潘丽嫒分享有关染色体平衡重排的高通量测序病例。

流金岁月

01

•核型不能明确的平衡染色体重排是否建议患者行高通量测序,NGS or TGS?

02

对于有异常表型的平衡易位是否行高通量测序,以明确基因和表型之间的关系?

03

对于普通平衡易位夫妇,高通量测序技术能否阻断易位染色体遗传给下一代?

百家争鸣

本次讨论主要围绕一例复发性流产但外院未行流产物遗传学检测,女方伴有染色体易位未明确的病例,进一步讨论诊治方案。

针对该病例,女方智力正常、生长发育未见异常,2次自然流产但外院未予流产物遗传学诊断,不能排除常见的染色体异常引起流产。可选择其他分子细胞遗传学技术手段如荧光原位杂交(FISH)进一步明确易位染色体片段来源,而高通量测序暂不作为首选方案。

对于原因不明的智力低下,伴有常规遗传学检测认为平衡性染色体结构重排的病例,可选择高通量测序进一步检查。针对表型异常的患者,目前临床上主流的高通量测序仍为第二代测序(NGS),该技术具有准确度高,生信分析流程成熟等优点。但由于其读长较短,在基因组高度重复区域的检测能力不及第三代测序(TGS)。TGS技术由于读长长,因此相对在检测结构变异上具有较大优势,目前处于高速发展阶段,生信分析软件和变异数据库仍在完善。在染色体结构重排方面,TGS目前主要是作为一种补充技术,对核型提示位点的精准定位或联合其他技术对可疑变异的进一步挖掘,尚未广泛应用于临床。在辅助生殖领域,TGS的应用前景巨大,在筛选核型正常胚胎方面已有报道。随着TGS技术的高速发展,其测序精准度的提高和生信分析的日益成熟,其临床的大规模应用指日可待,将造福更多患者。

病例准备|潘丽嫒

撰稿|潘丽嫒

审核|郭莉

广东省妇幼保健院

医学遗传中心

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