日本全国新冠确诊人数7月6日增至约4万5800人，相比上周3增至2倍。时隔约1个月再次超过4万人。东京都新确诊超过8000人，创出4月中旬以来新高。鉴于疫情迅速蔓延，日本政府已针对延长旅游援助措施“县民割（县民折扣）”的全国推广时间展开协调。旅游公司发出了担忧影响的声音。
日本厚生劳动省的开放数据（Open Data）显示，日本全国的7日平均新增确诊人数在5月中旬以后呈现减少态势，到6月中旬减少至1万3000多人。但6月下旬转为增加，疫情正在迅速蔓延。有分析认为原因之一是奥密克戎的新变异毒株、传染力可能比此前更强的“BA.5”和“BA.2.12.1”正在蔓延。
针对近期日本国内新增确诊病例的不断激增，日本厚生劳动省专家组认为，这是由于传染性更强的奥密克戎BA.5亚型正逐渐取代BA.2，成为日本当下的主流毒株所致。
由于2020年和2021年均在夏季出现疫情蔓延，所以日本对“第七波”疫情的警惕升温。BA.5在南非发现。据日本国立感染症研究所和欧美部门等称，目前在欧洲扩散开来，在葡萄牙已成主流毒株。同时在美国蔓延。在日本于5月在检疫中发现。
据国立感染症研究所推算，BA.5感染者所占比例将在7月第二周超过50%，7月内几乎全部替换。
BA.5可能具有规避从疫苗或感染史中所获免疫的特点，英国卫生部门截至6月推算认为，传染能力比此前主流的亚型BA.2高出约35%。京都大学教授西浦博分析现状称，“随着替换成新毒株，感染者增加呈现加速势头。”
据分析，疫苗接种经过一段时间后预防效果下降也有所影响。日本在去年12月启动第三剂接种。普通老年人也在今年年初开始接种，较早接种者距第三剂已经过约半年。以预防重症化为目的而仅限60岁以上等人群实施的第四剂接种5月刚启动，接种工作未取得进展。
向厚生劳动省就新冠防疫措施建言献策的专家组织主席胁田隆字称，未来因暑假等人际接触机会将增加，指出“近期可能持续增加”。
日本各自治体表示将加强警惕。爱知县知事大村秀章在7月6日的记者会上指出，目前的疫情属于“第7波”。福冈县7月6日自主发布了“福冈新冠警报”。
目前重症病床使用率较低的地区有很多，但接纳新冠感染者的病床使用率在冲绳县达到48％。在三重、岛根、爱媛、熊本、鹿儿岛县也达到20％以上。
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