关于WIPO ST.26 序列表制作的一些tips|sequence|wipo|勾选|序列|限定符

#本文仅代表作者观点，不代表IPRdaily立场，未经作者许可，禁止转载#

“国知局于2022年6月10日发布第四五八号公告，宣布从2022年7月1日起，向国知局提交的国家专利申请和PCT国际申请，包含于序列表的，该序列表电子文件应符合WIPO ST.26标准要求。”

来源：IPRdaily中文网（iprdaily.cn）

作者：邓旭北京派特恩知识产权代理有限公司

一、ST.26的背景

1998年11月，WIPO出台了《专利申请中核苷酸和氨基酸序列表的表述标准》，这就是WIPO ST.25。然后，国知局于2001年发布了ZC_0003-2001《核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表电子文件标准》。其结合我国的一些国情对WIPO ST.25进行了一些适当的修改。2001年11月，国知局公布ZC_0003-2001于2001年11月1日起，正式实施，一直沿用至今。但是，随着时代的发展和进步，ST.25逐渐暴露出起诸多弊端，特别是电子形式的标准化的深入，ST.25很难用于数据交换和自动验证匹配。

因此，出于对电子形式的需要，以及对序列精确描述和检索的需要，EPO于2010年向WIPO标准委员会提出了建立一个基于XML格式的生物序列标准ST.26。其目的在于统一全球的标准，使得原本25中模糊不清的规则得到统一，同时能够提高电子形式的验证匹配和检索，最后还能提高序列描述的精确程度。该标准于2010年10月开始由EPO负责牵头起草，2016年3月正式审议通过。这就是WIPO ST.26标准的由来。

国知局于2022年6月10日发布第四五八号公告，宣布从2022年7月1日起，向国知局提交的国家专利申请和PCT国际申请，包含于序列表的，该序列表电子文件应符合WIPO ST.26标准要求。因此，距今为止，该标准已经实行了一个月左右了，大家也都是处于摸着石头过河的阶段，欢迎各位同行共同讨论遇到的问题和解决方法。

二、WIPO Sequence软件的简介

与WIPO ST.26标准同步发布的，也就是一款全新的软件WIPO Sequence。这款软件据称由多国共同开发，因此，基本上各个国家不会在发布类似之前的PatentIn 3.5或者SIPO Sequence，以后都会统一使用WIPO Sequence，换句话说，这次发布的WIPO Sequence将会成为生物领域专利代理师以后长久打交道的工具。说实话，软件稳定性不佳，笔者在写这篇文章的时候，频繁出现项目不能加载的情况：

有些时候重启电脑可以解决，有些时候重启电脑仍然无法决绝。至今未能找到错误原因。

进入正题，首先，这款软件不是PatentIn，是有中文的，但是很多小伙伴却发现每次进去了之后都是默认为英文，然后都要手动的将它调成中文，笔者也曾经很苦恼这个事情。但实际上它是可以设置的。咱们首先打开WIPO Sequence，会看到如下的标签栏：

其中，有一个优选项，点开它，会跳转到下面这一个页面：

点击旁边笔型图案就可以进行修改啦，将工具界面默认语言修改为中文，这样每次打开之后都是中文了，再也不需要将其手动从英文调成中文。

接下来，简单介绍一下上面标签栏的各个标签：

第一个就是“项目”，也就是我们每一件申请需要制作序列表的地方，都在项目这一栏中完成。

第二个是“个人和组织”，可以把它理解成专属于代理师自己的整理库，可以把自己经常服务的申请人和发明人都增加进去，这样每次只需要勾选不需要重新输入一遍了。

右上角有一个“创建新个人或组织”，点开之后，就可以填写名称、语言，和拉丁名称。名称正常填写，语言根据需要进行选择，国内一般选择中文。

注意虽然此处拉丁名称没有标星号，没填写也可以保存。但实际上，在序列表制作过程中是必须的，不然无法保存申请人。因此，建议此处可以写申请人和发明人的英文名，没有英文名可以写拼音。

第三个是“生物体”，跟之前的所有软件一样，WIPO Sequence也是可以自主添加生物体的，而且在该处添加的生物体，会自动出现在往后所有项目中Organism中。

所以，其实关于在WIPO Sequence中争议颇多的“Artificial Sequence”这一选项的消失，很多同行建议用选项中存在的“Synthetic Construct”，即人工构建体替代。笔者却认为，可以自主添加Artificial Sequence，然后其在以后的项目中均可以选择，也不会报错。而“Synthetic Construct”，即人工构建体，笔者的理解其更多是偏向于载体之类的，而常见的核酸引物和探针其实并不属于人工构建体。

第四个是“帮助”，在该标签里面会获得一些其余的资料，包括软件的操作手册，标准ST.26的介绍。前者是有中文的，后者并没有中文。这个很容易就能在WIPO的官网上找到。

三、序列制作简介

接下来，笔者简单的对序列表的制作进行介绍。当然一些简单的事项就不赘述了，主要是对一些易错项和少见情况进行简介。当然，笔者也处于摸索之中，难免会出现问题和错误，请各位同行谅解。

首先是申请确定，基本上咱们面临的情况都是没有申请号的时候制作的，所以申请人档案名是必填的，此处可以填一些申请人或代理师自己的案号，档案名也会体现在项目栏中。

至于如果有申请号，那就勾选分配申请号后，然后填写对应的号码和日期就行了。

接下来是申请人和发明人，如果如笔者所说创建了自己的发明人，则可以选择现有发明人并在下拉菜单中进行选择。

但是需要提醒的是，如果只操作到此处，在最后的验证过程中会报错，在保存了发明人之后，需要代理师手动回去选择修改，将右下角的“标记为主要”打勾并保存。因为，ST.26只允许出现一个申请人，所以，需要将第一申请人标记为主要，在最后的格式中也只会出现第一申请人。

再次是发明名称，此处并没有过多的注意事项，填写对应的发明名称和语言即可。

最后则是重头戏，序列。由于ST.26对于序列的各种特征规定的非常严格，所以在日常的制作中，代理师们需要根据序列的具体信息添加特征。

点击创建新序列，则会出现如下方框：

序列名称、分子类型、残基大体上都跟之前使用PatentIn差不多，此处的生物体名称，如果咱们自主创建了人工序列，则此处下拉菜单中就会有“Artificial sequence”这一选项，是可以进行选择的。

需要提醒的是，残基，也就是输入序列的地方，不能再像之前使用ST.25一样可以随意输入各种字符了，否则会出现如下提示：

现在核苷酸能使用的字符如下所示：

氨基酸能使用的字符如下所示：

总的来说，除开上述字符，核苷酸一律用n，氨基酸一律用X代替。然后再后续特征中选择添加功能，并根据具体情况进行描述。

例如，我们需要创建一段核苷酸序列atciiiatgg ggggg那么，我们输入的应该是atcnnnatggggggg，然后创建序列，并在如下图所示中选择添加功能：

选择添加功能后将会出现如下选项：

我们在特征键的下拉菜单中根据需要选择modified base，然后再特征位置标注4..7，这样的意思是第4位到第7位为修饰碱基。特征键下拉菜单中有多种选项可以选择，代理师可以根据序列具体序列信息进行选择。而位置的表述在ST.26中也有明确描述，如下所示：

根据位置关系自行选择输入模式即可。

在位置和特征键均描述完之后，则会出现如下所示的限定符值选择：

在限定符值的下拉菜单中选择i，即可，点击创建特征，就生成了我们想要创建的序列。

这样一个序列基本上就创建好了。需要提醒的是，如果在限定符值的下拉菜单中并未找到我们想要的类型，则可以选择OTHER，并在再次弹出的note中，继续填写限定符值，如下所示：

但是，笔者却至今卡在此处，不知道如何解决该问题。如果是自己自定义的限定符值，按照它的操作，均填写完毕后会报错，如下所示：

该错误描述的“特征位置”暂时并不清楚其代表的含义。笔者有同事让我在项目再开始的设置中设置非英文自由文本语言代码，但仍然未解决该问题。

以上就是创建一个序列，特别是含有少见序列信息的序列的方法。当然，由于时间较短，笔者也只是简单的介绍一些知识，遇到更为特殊信息的序列，其处理方法肯定更为复杂和少见，但是笔者今天所介绍的方法，应该足以应付95%以上的序列创建。

除此之外，还有一些注意事项需要各位关注：

1、虽然国知局规定了在以后的申请中，均只需要递交XML格式的序列表，而不需要TXT格式的序列表。但是国知局同样注明了为了方便计算费用，在递交时，仍然需要递交PDF版本的序列表，而把XML格式转化成PDF格式是会出现乱码而且不太美观，但是WIPO Sequence自带打印功能，就在项目名称旁边有一个打印按钮，如下图所示，即可完成打印，截止到目前为止，笔者递交的国内申请，PDF均是递交的通过这一途径打印出来的PDF。