1999年10月31日，埃及航空990号班机空难发生，它是来往开罗和洛杉矶的定期航班。当天，这架飞机起飞后30分钟从雷达上消失，并失去联络。飞机由原定的飞行高度急降再爬，最后就一直急降直至坠落大西洋，整个过程只有36秒，最终造成218人遇难。

关于此次事故的原因至今没有定论。2000年8月，美国有关机构公布了一份调查报告，暗示这起空难可能是由飞机副机师的“自杀性行为造成的”。埃及对此表示强烈反对，强调应从技术角度和其它方面查找事故原因。