根据成都大熊猫繁育研究基地官网，与人类和其它哺乳动物疾病一样，大熊猫疾病通常分内科病、外科病、产科病、传染病和寄生虫病。虽然经过长期的进化和环境改变，大熊猫已经从以肉食类食物逐步演变到今天的以植物性食物-竹子为主食的生理特点，但它在分类学上仍然属于食肉目凶猛动物。
1、大熊猫的内科疾病
大熊猫的内科疾病主要表现在消化系统、呼吸系统、泌尿系统、神经系统、造血系统等。最常见的疾病有急性胃肠炎、慢性胃肠炎、感冒、肺炎等；对大熊猫生命安全最具有威胁的疾病主要包括：中暑、肠梗阻、肠钮转、肠套叠、急性胰腺炎、肾功能衰竭等。
2、外科疾病
大熊猫外科疾病最常见的外伤、骨折、颅脑损伤、肿瘤等，这些疾病都必须通过外科手术才能完成治疗。但由于大熊猫会不停地抓扯伤口从而破坏伤口的愈合，因此，大熊猫外科疾病治疗成功的关键在于手术后的护理。
3、大熊猫产科疾病
大熊猫产科疾病主要包括：假孕、流产、难产、外阴水肿、子宫内膜炎、卵巢囊肿、输卵管堵塞、不育症等。最常见的疾病主要有假孕、流产。大熊猫初生幼仔体重只占母体重量的1/1000，因为胎儿个体大小发生难产的可能性极小，最大的可能性通常都发生于母兽分娩时子宫收缩无力而出现产力性难产。到目前为止，全球范围内仅报道了一例大熊猫的难产。
4、大熊猫传染病
大熊猫传染病是一类对大熊猫种群健康和生命安全具有极大威胁的疾病。经过全世界科学家们的共同努力，目前在大熊猫已知传染病的治疗和预防上已经取得了重大突破。专家们已经成功地找到了诸如侵袭性大肠杆菌O152引起的大熊猫出血性肠炎、轮状病毒感染导致的大熊猫断奶幼兽顽固性腹泻病和慢性营养不良综合症等病的有效治疗方法和预防措施，并已经筛选出专门用于大熊猫抗击犬瘟热病毒感染的预防疫苗。
5、大熊猫寄生虫病
大熊猫寄生虫包括体内寄生虫和体外寄生虫2大类。到目前为止，科学家们在大熊猫身上共发现22种寄生虫。但大熊猫最为常见的寄生虫病主要包括蛔虫病、痒螨病、蠕形螨病、蜱病等。
从寄生虫病的感染率和感染强度情况来看，圈养大熊猫与野外大熊猫存在着明显不同。圈养条件下，大熊猫由于受到人类良好的医疗护理，寄生虫病的感染率和感染强度往往很低，通常不会对生命安全构成严重威胁。但在野生条件下，大熊猫无法得到人类良好的医疗护理，寄生虫病的感染率和感染强度都远远高于圈养大熊猫，并已成为野生大熊猫消瘦和发生死亡的主要病原。科学家研究发现：野外大熊猫蛔虫感染率达到100%，有一只野外大熊猫感染蛔虫数量达到1605条。
在大熊猫疾病预防和控制领域，成都大熊猫繁育研究基地先后攻克的难题包括大熊猫病毒性心肌炎防治技术、大熊猫慢性营养不良综合症防治技术、大熊猫出血性肠炎病（侵袭性大肠杆菌EIEC O152感染）防治技术等。
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