产品背景介绍
植物广靶
非靶向代谢组学常用高分辨质谱(qTOF/Orbitrap) 来定性代谢物,通量高、二级谱图分辨率高,但是受限于动态范围及灵敏度;靶向代谢组利用标准品物质进行代谢物定性定量,动态范围宽、灵敏度高,但通量低。
植物广靶代谢组学,区别于现有代谢物检测方法,是一种整合了非靶向代谢组“广泛性”和靶向代谢组“准确性”检测技术优点的新型代谢组检测技术,具有高通量、超灵敏、广覆盖、定性定量准等特点,专门针对植物样本自建植物数据库,可实现在植物样本中一次性定性定量检测上千种代谢物,为植物复杂代谢物的检测提供了更高效的方法,为解析代谢通路和生物学机理研究提供了重要基础。
植物广靶代谢组学数据库
产品技术优势介绍
植物广靶
▶物质鉴定全面:高通量,一次性定性、定量检出900+代谢物;三黍广靶技术自建库,定性结果准确有利于数据分析,无需标准品,节约成本。
▶注释信息全面:超90%KEGG覆盖度;超90%初级次级代谢物分类;超90%中英文名注释,Pathway分析、功能分析准确可靠;多组学联合分析,相关性分析准确可靠。
▶物质类别覆盖广:采用多物种、多样本类型反复实测建库;针对多类别化合物特性进行多种前处理方式反复实测建库;植物代谢物覆盖度高。
▶项目实测代谢物数量多:高达700-1300个植物代谢物以实测项目物质数量870+为例(黄酮类250+,生物碱120+,多酚90+,萜类110+,香豆素等分类300+,其他50+)。
产品参数介绍
植物广靶
▶项目流程
▶技术参数:
植物组织:鲜样≥2g,干样≥1g,冻干粉250mg
储存和运输:液氮或-80°C保存;足量干冰运输,避免反复冻融
检测平台:Qtrap 6500+, Sciex
常规项目周期:25个工作日(从样品完成入库之日起)
▶实测结果
实测项目鉴定代谢物数量、实测项目鉴定代谢物分类
▶XICs提取离子流图
产品应用方向
植物广靶
▶ 植物样本中代谢物组分鉴定
▶ 植物主要次级代谢途径研究
▶ 植物抗虫抗病机理研究
▶ 植物逆境抗性(盐、干旱、病虫害等)机理研究
▶ 植物-微生物相互作用研究
▶ 根系分泌物组分鉴定
产品案例分析
植物广靶
题目:Integrated Metabolomics and Transcriptomics Analyses Revealthe Metabolic Differences and Molecular Basis of NutritionalQuality in Landraces and Cultivated Rice
期刊名:Metabolites
发表时间:2022, 12(5), 384
技术平台:广泛靶向代谢组、转录组、重组蛋白表达及体外酶活分析
材料:114份水稻种质资源:35个地方品种和79个栽培品种
▶方案设计
▶结果展示
1.利用广谱代谢组学方法构建了水稻种子代谢组数据库,包括985个优质代谢信号。通过标准品和数据库鉴定了549种代谢产物。通过主成分分析(PCA)、聚类热图、分类分析,在栽培稻和地方稻种子中鉴定出90种显著不同的代谢物。与栽培水稻种子相比,地方品种种子中花青素和黄酮类化合物的含量更丰富。
2.对4个栽培种和6个地方品种种子进行了代谢组学分析,通过PCA、韦恩图等分析发现种子颜色可能是导致品种和地方种种子萌发过程中代谢差异的原因。转录组测序分析结果显示差异基因表达(DEGs)主要富集在苯基丙烷代谢和氨基酸代谢。转录组与代谢组联合分析结果表明在地方品种种子萌发过程中类黄酮和花青素的积累出现明显差异。
3.不同类型水稻种子花青素代谢多样性及其分子机制研究:构建相关蛋白表达载体并进行体外酶活实验。地方品种的花青素和花青素合成关键基因均高于栽培水稻。
▶思路总结
本研究通过广泛靶向技术证明了次生代谢物在有色水稻种子萌发过程中起到了关键作用,并通过筛选出的次级差异物总结出类黄酮和花青素在地方品种种子萌发过程中累计存在显著差异,为进一步研究地方水稻营养品质机制提供基础。
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