武警重庆总队成立于1998年，组建之初就是副军级，还设有船艇支队

在“山城”重庆，驻扎着一支素质过硬、群众信赖的“精锐之师”：武警重庆总队。武警重庆总队也是一支历史悠久、战功卓著的英雄部队，其最早前身可追溯至解放军原晋冀鲁豫军区太岳军区第十八军分区平遥县游击大队以及原第二野战军第12军34师102团，而这两支部队都是从战火中一路走来、立下过赫赫功勋的。1950年6月，原中国人民公安部队重庆市公安局公安总队成立，也标志着武警驻渝内卫部队从此诞生。

1982年12月，驻渝武警内卫部队重新组建，并在此后的16年时间里一直隶属武警四川总队建制领导。1998年1月16日，经军委批准，武警总部独立组建了副军级的武警重庆总队；需要指出的是，其他武警内卫总队组建之初都是正师级，然后再升格为副军级，而武警重庆总队则是自成立之日起就直接定为副军级，且保持至今。