但是，他的政治理想和施政纲领，与后来实际掌控国民党走向、并影响了中国近代史的重要人物蒋介石不一致。这成为两人后来多次产生冲突根源，这些冲突，又随着1949年这种大变局的到来，变得极为尖锐。二、1949年国共和谈时，与蒋介石在政治上分道扬镳由于早年就投身了革命，且顶着“中山先生”独子的光环，所以孙科在国民党内部长期处于高位，并参与了一系列重大事件。特别是在1948年到1949年时，其担任行政院长，直接参与了当时的国共谈判。

这一刻，可以说是孙科人生最高光的时刻。但是身处高位者的苦衷和无奈，不是外人所能理解的。孙科从参与国共谈判开始，就陷入了一种复杂的三方博奕关系。在国民党内部，蒋介石、李宗仁、孙科，都在竞争和中共进行和谈的主导权。由于三者的想法存在根本性的分歧，所以矛盾在博奕中不断加剧。

孙科是国民党内部最先提出必须和谈的要员。在孙科的看来，局势变化，意味着国民党必须做出重大改变。于是，孙科，提出了“光荣的和平”，要求蒋介石下野，由行政院来接管国共和谈工作。当然，这一想法最初提出时较为委婉，以免蒋介石难堪。在1948年10月份，国民党军事上败象显露，而国民党统治区的经济秩序也开始崩溃。孙科审时度势，决定尝试着手和谈，以挽回败局。为了找到更多人支持自己，孙科不断与其他国民党要员，如于右任、张群、张治中等人交换意见。于是，有人就建议让蒋介石“休息”，这遭到了蒋介石本人的愤怒拒绝。不过，形势的发展超出所有人的预料。

当年11月，在前线的淮海战场上，解放军取得了第一阶段的胜利，国民党损失18个整编师。来自四面八方的激烈批评，让蒋介石不得不做出让步，在11月26日同意孙科出任行政院长，并主持国共和谈。于是，孙科开始积极组建和谈内阁，并要求司徒雷登向蒋介石施压，要求其交出一切实权。孙科的努力看起来取得了效果，至12月12日时，其获得了人事权和决策权。但蒋介石本人并不想真心和谈，蒋介石在对孙科作出让步的时候，也在积极谋划，意图调集军队在前线夹击解放军，以稳定江淮地区的局势。

蒋介石既然有这种安排，自然不会真正让孙科放手和谈，所以蒋介石一边在表面同意和谈，一边又对孙科暗加掣肘。这导致孙科原本预计一个月能完成的组阁工作，又拖了一个月才完成，并且内阁人员组成及性质也和自己设想的不一样。孙科对此十分气愤，蒋孙矛盾愈演愈烈。

孙科在全力以赴与蒋介石较量的时候，新的一方势力也崛起了。由于孙科要求的和谈，赢得了很多人的支持，蒋介石无法公然反对。而蒋介石的掣肘，让孙科实际工作寸步难行。这样以来，双方都陷入胶着状态。可此时，前方的战局也在急速发展，解放军已经调集兵力，准备包围杜聿明集团，将其一举歼灭。国民党内外对此忧心忡忡，于是桂系军人乘势而起。以李宗仁、白祟禧为代表的军方实力派出面，逼蒋介石下野。就这样，出于不同的目的，孙科和李宗仁形成了事实上联合的局面。这相当于文武官员同时“造反”，蒋介石不得不同意于1949年元月引退。

但是蒋介石却又留下了后手，他同意由李宗仁“负责采取任何为民族谋福利”的政策。蒋介石这看似顺理成章的安排，其实是无形之中又将了孙科一军，将原本属于孙科掌控的国共和谈主导权转移到了李宗仁手中。要知道，在此之前，李宗仁的桂系属于地方势力，是没有资格主持国民党中央政局的。而孙科则不同，孙科一直身处国民党中央，并且受人欢迎，本来就可以主持中央。蒋介石这样一安排，相当于赋予了李宗仁主持中央事务的权威。至此，李宗仁成为实力派玩家，而孙科被削弱，国民党也进入了以蒋介石为代表的总统府、以孙科为代表的行政院、李仁宗为代表的军队三方博奕的局面。

三、无力左右局面，被迫离开

孙科利用这一局面，再次向蒋介石施压。顶不住压力的蒋介石最终宣布于1月21日“引退”。1月22日，李宗仁成为了代总统。虽然蒋介石一直称自己下野是受桂系逼迫，但是孙科联络国民党高层要员向其施压无疑在其中发挥了巨大作用。所以此时在与蒋的斗争中，孙科暂时取得了胜利。蒋介石下野后，孙李二人的矛盾浮现。对于国共和谈，代总统李宗仁和行政院长孙科都想让事情往自己希望的方向发展。当时孙科的想法是，尽可能的维持国民党的统治，所以他把“光荣的和平”作为口号，希望谈判要“公平合理”，并且不能否定国民政府在世界上的代表性。

而李宗仁桂系的打算是，尽可能的保证桂系的实力。所以，李宗仁一边防止蒋介石复出，一边幻想在长江两岸实现分治，由桂系来统治长江以南的地区，实现不行的话，双方组建联合政府也可以。但是，蒋介石虽然下野，并未真正放弃权力，他还在暗中观察局势，以便伺机而动。蒋介石明白，军队还掌握在自己手里，这就是自己最大的本钱。有了军队，哪怕下野了也能有巨大的影响力。

孙科（右二）

孙科虽有名望，广受欢迎，被很多人视为承载着孙中山的理想、足以团结大家的人。但孙科最大的缺点是不掌握军队，也没有真正属于自己的政治势力。相比之下，出身桂系的李宗仁才是真正的实力派。李宗仁不但掌握着数量可观、战斗力极强的军队，还拥有一批坚定的追随者。所以，随着局势的发展，蒋介石先后选择了与孙科和李宗仁的合作，并击败了两者。一开始，孙科反对李宗仁接受毛主席提出的八个条件作为谈判基础。

于是，桂系开始施加更大的压力让孙科辞职。此前，由于有蒋介石的支持，孙科还可以顶住压力，但现在，孙科遭受的致命一击偏偏也是来自蒋介石。由于痛心国民党的失败，孙科在国共和谈期间把国民党失败的原因归咎于蒋介石发动了内战，默认了蒋介石是“战犯”的事实，这让蒋介石极为不满。于是蒋介石开始调整策略，转而支持李宗仁。

在2月17日，蒋介石表示，既然李宗仁想调换行政院长，那就可以自行决定。到3月初，蒋介石更进一步明确表示，不会再勉强支持孙科，因为“大势所趋”，“只有听其辞去”。蒋介石在背后的一击，让孙科不得不于3月8日辞职。说到底，孙科虽有良好的想法也得到了国民党内部的广泛支持，但其对国共和谈的设想不切实际，又没有执行自己想法的实力。所以最后失败是可以预料的。对孙科来说，这次失败，无疑是人生的一大挫败。这表明其政治抱负再一次落空。而其本人和蒋介石之间矛盾，也在这次争斗中不断变大了。说蒋介石内斗内行，外斗外行，这是十分精准的评论。蒋介石在已经下野的情况下，依然可以遥控局面，操纵军队，从而挫败了自己在国民党内部的挑战者。

不过，赢得了斗争的蒋介石也没来及得庆祝胜利，蒋介石的军队就在解放军面前，迅速的崩溃了，蒋介石本人也不得不逃往台湾岛。蒋介石的失败，让国民党政权陷入一片混乱之中。孙科和其他国民党要员一样，再次面临着何去何从的选择。也许是出于对蒋介石的失望及不满，也许是因为两个人刚刚还在政治斗争中互为对手，所以，孙科没有选择随蒋介石前往台湾岛，而是远赴海外谋生。四、晚年落寞，再次与蒋合作在1949年3月辞去行政院长后，孙科就从广州移居到了香港。其后，孙科又先后客居欧洲、美国长达16年。

1965年10月29日，孙科乘坐飞机抵台，在台北松山机场受到蒋经国带领的接待人群的热烈欢迎。在大陆期间，孙科对蒋介石的做事风格有诸多指责。但在其晚年赴台之后，却多次公开发表演讲，表明自己拥护蒋介石的政治立场。而蒋介石也投桃报李，提名孙科为“考试院”院长。于是，孙科在脱离国民党组织系统多年之后，再次成为国民党的政治要员。在此后的岁月里，孙科不辞“劳苦”，积极参与了多方活动，直到1973年病逝世于台北。

五、一生功过，难以评说