撰文丨王聪
编辑丨王多鱼
排版丨水成文
由于技术的进步和成本的降低，外显子组和基因组测序的数量正在迅速增加。除了外显子组和基因组测序的临床背景外，涉及外显子组和基因组测序的研究计划正在招募非常大的患者队列。英国生物样本库（UK Biobank）研究中50万参与者的外显子组或基因组测序数据已经获得，而All of Us和Our Future Health项目正计划分别对100万和500万参与者进行测序。这些项目生成的数据将包括参与者携带的致病基因型。
2021年5月，美国医学遗传学和基因组学学会（ACMG）推出了与心血管、癌症和代谢等疾病相关的73个基因的可操作基因型，这些基因型可采取预防或治疗措施 。2023年6月，ACMG发布了更新版本。 但 目前还 缺 乏这些基 因中可操作基因型与 寿命关联的评估。
2023年11月9日，deCODE公司（安进旗下公司） 的研究人员在《新英格兰医学杂志》（NEJM）发表了题为 ：Actionable Genotypes and Their Association with Life Span in Iceland 的研究论文。
该研究显示，4.05%的冰岛人携带了ACMG指南中的一个或多个可操作基因型，这些基因型引起的疾病包括心血管疾病、癌症和代谢疾病。携带这些可操作基因型的人比非携带者寿命更短，在癌症易感基因型的携带者中观察到最大的影响，他们的中位生存期比非携带者短4年。
由于向人群提供精准医疗需要相当多的人群基因组学、转录组学和蛋白质组学数据，而冰岛人特别适合这项工作，因为位于冰岛的deCODE公司（安进旗下公司）此前已经积累了大量冰岛人群的此类数据。
在这项研究中，研究团队重点关注了那些增加疾病风险的基因型，这些疾病的预防或治疗措施已经建立，这些基因型被称为可操作基因型（actionable genotypes）。研究团队使用了一个基于人群的数据集（包括约5.8万名全基因组测序的冰岛人），以评估携带可操作基因型的个体比例。
利用美国医学遗传学和基因组学学会（ACMG）指南中列出的73个可操作基因（actionable genes），该研究发现，4.05%的冰岛人携带了这些基因中的一个或多个可操作基因型，这些基因型引起的疾病包括心血管疾病、癌症和代谢疾病。
该研究还评估了可操作基因型与其携带者寿命之间的关系。在癌症易感基因型的携带者中观察到最大的影响，他们的中位生存期比非携带者短4年。例如，携带BRCA2基因的致病突变的人易患乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌，他们的寿命相比非携带者缩短了7年，而携带LDLR突变会导致高胆固醇和心血管疾病，他们的寿命相比非携带者缩短了6年。
论文通讯作者、deCODE公司科学家Patrick Sulem表示，这项研究中发现的可操作基因型，都被预测会导致严重疾病，可能会对寿命产生巨大影响。
该研究显示，每25人中就有1人（4%）携带一种可操作基因型，这导致了他们平均寿命的缩短。特定可操作基因型的携带者更有可能死于这些基因型引起的疾病。携带BRCA2基因致病突变的人，死于乳腺癌、卵巢癌或胰腺癌的风险是正常人的7倍。此外，他们患上前列腺癌的可能性是正常人的3.5倍，死于前列腺癌的可能性是正常人的7倍。
deCODE公司首席执行官Kari Stefansson表示，对参与者的可操作基因型的识别和披露可以指导临床决策，这可能会改善患者的结局。因此，这些发现具有减轻个人和整个社会的疾病负担的巨大潜力。
论文链接：
https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMoa2300792
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