军改前，武警森林部队也是一支作风优良、规模庞大的现役部队，其领导指挥机构叫作“武警森林指挥部”，军政主官称为“司令员、政委”（均为正军级武警少将）。当时，武警森林指挥部机关设有司令部、政治部和后勤部，同时国家林业局局长会兼任武警森林指挥部“第一政委、党委第一书记”，指挥部下辖有9个正师级的森林总队以及1个直升机支队。而武警新疆森林总队就是其中的重要力量之一，自组建以来，总队一届又一届官兵为保护新疆的和谐稳定、保护新疆的生态资源做出了巨大贡献。

据公开资料显示，武警新疆森林总队成立于2002年10月10日，是经国务院和中央军委批准，与武警四川森林总队、武警西藏森林总队同时组建成立的威武之师，且级别明确为正师级。当时，武警新疆森林总队机关设有司令部、政治部和后勤部，下辖巴州森林支队、伊犁森林支队、阿勒泰森林支队、乌鲁木齐直属森林大队、乌苏直属森林大队以及1个教导队，主要承担森林防火灭火、生态资源保护、维稳处突、武装巡逻、反恐威慑等多样化任务。特别是后面这三点往往会被大家忽略，因为在人们印象中“维稳处突、武装巡逻、反恐威慑”似乎都是武警内卫部队的职责，但实际上武警森林部队也肩负类似任务（所以武警新疆森林总队也配有相应的装甲车、运兵车和轻重武器）。

而作为武警部队部署在新疆的生态保护专业现役力量，武警新疆森林总队一方面不断提升部队的灭火能力和知识储备、提升实战训练水平，另一方面也在灭火装备、机动载具等方面进行了强化。自组建驻防以来，总队先后组织防护勤务296次、灭火作战104次，曾连续17年确保辖区未发生重、特大森林火灾，有效保护了100多种国家重点保护的野生动物。其中，武警新疆森林总队常态化组织部队深入自然保护区，打击盗猎、偷挖等违法犯罪行为，被誉为是新疆保护野生动物、建设良好生态环境的“主力军”。

但在此轮军改中，为了贯彻落实“军是军、警是警、民是民”的改革方针，武警森林部队整建制退出现役。2018年10月1日，武警森林部队集体转隶移交应急管理部，并和武警消防部队一起组建为国家综合性消防救援队伍，现役编制改为行政编制。其中，武警新疆森林总队被改编为“新疆森林消防总队”，目前隶属国家消防救援局领导、实行垂直管理体制，总队下辖巴州、伊犁、阿勒泰3个森林消防支队以及1个特勤大队、2个直属森林消防大队。

还需要指出的是，新疆森林消防总队除了负责新疆范围内的执勤任务外，还承担陕西、山西两省的森林/草原灭火、防火任务。因此，新疆森林消防总队每年都会组建跨省机动驻防队伍前往陕西、山西境内的相关执勤点驻防。

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