影响伊朗和巴基斯坦之间关系的因素主要有三个：派别、边境和反恐。尤其是后两者，不仅存在两国之间，也存在于两国与阿富汗之间。

俾路支问题是影响三方关系的重中之重。例如，伊朗和巴基斯坦都有一个俾路支省，而且一直存在恐怖主义和分离主义问题。

此次伊朗对巴基斯坦境内目标的的空中袭击，应该是对前不久伊朗境内发生的两起恐袭事件的回应，另一场对叙利亚境内目标的袭击也是如此。

当然，巴基斯坦也一直对俾路支的恐怖主义问题十分头疼，每年战损很多。但伊朗的做法一是越界了，而且是空袭，二是造成了平民伤亡。所以，必然引来巴方的谴责。从中也能看出，跨国反恐是一件很敏感的事情，因为它涉及主权。

从军事实力等各方面来讲，巴基斯坦不同于伊朗上次发动袭击的伊拉克和叙利亚。另外伊朗与巴基斯坦在能源、电力、贸易等方面都有合作。在这次袭击之后，伊朗媒体有意发布了一条十天之前双方举行海上联合军演的消息，以此展示双方的合作关系。

总的来说，双方之间的分歧、摩擦与合作还会持续下去，这就是国际关系的复杂之处。