Ginkgo Bioworks 仍在持续提高平台化能力。
当地时间本周三，合成生物学上市公司 Ginkgo Bioworks（NYSE: DNA）官宣达成了 3 项收购协议，领域涵盖了基因诊断和 AI +制药，其中包括 CRISPR 先驱张锋创办的分子诊断公司 Proof Diagnostics。
这些收购标志着 Ginkgo Bioworks 在人工智能生成化合物和基因编辑技术方面的显著扩展，也是该公司更广泛战略的一部分。同日，该公司还宣布计划通过新的技术网络（Ginkgo Technology Network，GTN）增强其为客户研发产品的能力。
该技术网络包含来自 Ginkgo Bioworks 超 25 家开发商合作伙伴和之前收购的技术和产品，旨在为其研发客户提供“更强大的端到端解决方案”。这些合作伙伴分布在人工智能、基因药物、生物制品和制造等不同领域。
▲图 | 今日 Ginkgo Bioworks 共发布了 5 条公告（来源：公司官网）
推出技术网络，重点关注 AI，25 家公司加入
作为一家合成生物学平台型公司，Ginkgo Bioworks 并没有自己的产品组合，而是基于客户需求投资和搭建基础设施和平台，从而向客户提供工具和功能服务。比方说，Ginkgo 的业务需要整合现有技术手段和新方法，包括高通量分析设计技术、编辑细胞的新方法、经优化的 AI 模型等。
该公司在新闻稿中详细描述到，“成立 15 年以来，我们一直专注于构建和集成平台技术，高效全面满足客户多样化的项目需求。除了自研能力之外，我们还收购了十几家公司，还与许多不同领域的公司建立了合作。整合这些合作伙伴的新型或者多元化技术，并通过公司的自动化和数据集成到系统中。这为公司在系统集成方面积累了独特的经验，可以为客户提供一套强大的服务体系。与此同时，我们仍然在不断通过多种方式扩展公司的集成系统。”
如今，该公司已经成为了一家在集成平台技术和建立战略合作伙伴关系方面拥有超 15 年经验的资深平台技术集成玩家。该公司迄今为止最大的一笔收购案是收购合成生物学上市公司 Zymergen，这笔交易为其平台集成了强大的自动化和软件功能以及提供不同的生物工程方法经验。
现在，该公司计划通过推出一个技术网络以及收购更多初创公司进一步扩大其服务范围。该技术网络是一个具有技术突破性的生态体系，汇集了超 25 家 Ginkgo Bioworks 合作伙伴的前沿技术，涵盖人工智能、基因药物、生物制剂和制造等多个领域。目的是通过技术和经验集成为客户提供更强大的端到端解决方案，提高客户项目的研发成功率。
（来源：公司官网）
根据新闻稿中的描述，该技术网络的核心关注领域之一是人工智能。随着越来越多的公司寻求利用生成式人工智能的最新工具，采用集成的研发方法并在计算模型中构建强大的反馈循环已成为关键的差异化因素，有助于确定项目的成功。将合作伙伴的模型和人工智能功能与 Ginkgo Bioworks 的自动化堆栈相集成，可以帮助合作伙伴构建更高效精确的模型，希望可以将这种闭环功能服务提供给技术网络合作伙伴以及当前和未来的客户。
Ginkgo Bioworks 的首批技术网络合作伙伴包括 310.ai 、Advanced Medicine Partners、Avecris、BioMap 以及 bit.bio 等等。
▲图 | 部分 Ginkgo Bioworks 首批技术网络合作伙伴（来源：公司官网）
后续，该公司计划基于初始客户反馈，将新的合作伙伴添加到技术网络中，扩展技术集成系统，并帮助消除限制当今研发进度的孤岛和转换成本。
值得一提的是，同日官宣的 3 笔收购也属于该技术网络战略的一部分。该公司称收购基于 CRISPR 的分子诊断公司 Proof Diagnostics 将为其客户提供更高质量的基因编辑服务，收购 AI+基因药物公司 Patch Biosciences 是为了强化公司提供基因治疗服务、细胞治疗服务和 RNA 治疗服务能力；收购 AI 药物发现公司 Reverie Labs 旨在加强其 AI/ML 驱动的发现服务产品，加速构建下一代生物基础模型，提高客户项目的人工智能驱动药物发现能力。
Ginkgo Bioworks 方面表示，计划整合 Reverie Labs 的模型、软件和工作流程，推进其 AI/ML 驱动的实验设计基础设施。Reverie Labs 的化学生成式人工智能平台也将集成到 Ginkgo Bioworks 的工具包中，支持小分子项目。此外，Reverie Labs 公司 AI 团队的四名重要成员也将加入 Ginkgo Bioworks，首席技术官 Ankit Gupta 将担任 Ginkgo 的 AI/ML 推进主管。
持续强化基因治疗业务，已收购张锋公司
技术网络旨在促进人工智能、基因药物和生物制品等不同领域的创新。基因编辑能力和基因治疗是 Ginkgo Bioworks 的重要关注方向之一。根据官网的介绍，Ginkgo Bioworks 的基因治疗业务包括可提供用于基因治疗的 AAV 衣壳，涉及到工程化修饰和规模化生产等。
继 2021 年公开发行后，Ginkgo Bioworks 积极推行通过收购实现增长的战略，在基因治疗业务方面亦是如此。截至目前，该公司已通过这些收购和合作提高基因治疗服务能力，比方说将 StrideBio、Circularis 等公司整合到其生态系统中，同时还与下一代基因编辑公司 Arbor Biotechnologies 达成合作，推进发现和开发更精准的基因编辑器。
通过收购 StrideBio，该公司获得了这家公司的 AAV 衣壳发现和工程平台，并将这些功能整合到其端到端 AAV 基因治疗开发平台中。Ginkgo Bioworks 方面称，这笔收购加强了公司基因治疗的端到端研发能力，可以为基因治疗制造提供衣壳、有效负载和细胞系优化的研发服务；Ginkgo Bioworks 还收购了 Circularis 专有的环状 RNA 和启动子筛选平台、与 Biogen 合作改进 AAV 生产、与 Selecta Biosciences合作开发更具靶向性和低免疫原性的 AAV 衣壳。
而最新的两笔收购是该公司更广泛收购基因治疗公司技术平台的一部分。有媒体称，此次收购加强了 Ginkgo Bioworks 在基因治疗市场上的地位，将收购公司的技术平台整合之后，预测这些创新技术可能会重新定义基因编辑和基因药物。
Proof Diagnostics 是一家 2020 年成立的生物技术公司，由张峰、麻省理工学院麦戈文脑研究所的 Omar Abudayyeh 和 Jonathan Gootenberg 以及 Sid Shenai 联合创办。该公司正在开发针对 SARS-CoV-2、Flu A/B、RSV 等的低成本、快速、易于使用且灵敏的基因编辑诊断系统。
该公司的底层技术是张锋团队发现的一类由大量转座子编码的 RNA 引导核酸酶，称之为 OMEGA 系统（包括 IscB、IsrB、Tnp8）。OMEGA 系统使用 RNA 指导切割 DNA 双链，即 ωRNA。这些核酸酶很小，仅为 Cas9 的大约 30%，其可能更容易被递送到细胞中。
（来源：Science）
因此，Proof Diagnostics 的 RNA 可编程、非 Cas 酶库及其相关知识产权是 Ginkgo Bioworks 收购的重点。Ginkgo Bioworks 在一份声明中表示，OMEGA 酶比基因编辑中使用的许多核酸酶“更小、更多样化。这些酶因其独特的大小和多样性极具价值，有望为基因编辑挑战提供了潜在的突破。
Ginkgo Bioworks 的首席执行官 Jason Kelly 在一份声明中指出，“整合 Proof Diagnostics 的技术和酶库为我们的客户提供了一种新工具，可以克服当前基因编辑系统的局限性。通过将 OMEGA 整合到我们的基因编辑工具包中，可以加强公司提供基因治疗服务的能力，从而为基因组医学提供更通用的方法。"
第二笔收购涉及到 Patch Biosciences，这是一家总部位于纽约的人工智能平台开发商，Ginkgo Bioworks 将把后者的机器学习模型和下游检测整合到其现有平台中，为合作伙伴提供合成启动子和非翻译区 (UTR) 工程化修饰的新功能。
素材来源官方媒体/网络新闻
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