蒋南翔是建国后清华大学任职时间最长的校长，在他担任校长期间，国内时局风起云涌，他和副校长钱伟长的矛盾，以及将钱伟长定为右派等一系列问题，也一直被后世诟病，那么两位学术界，教育界的泰斗级人物是如何结怨的呢？
蒋南翔1952年担任校长后，就开始着手改造清华大学，他在学校公开发表讲话，老清华是封建买办们建立的贵族大学，这所学校从老师到学生绝大多数一直亲美，崇美，认为美国的一切都是美好的，这是典型的资产阶级学校，我们要破除英美资产阶级教育的旧传统，把他改造成适应社会主义工业的新大学，要突出党的领导，要突出政治。
讲话后蒋南翔开始着手实施改革，很多旧规则被改变，也让很多人对蒋南翔的大家长作风越来越不满意，但随之而来的运动让清华内部的斗争更加激烈，从批判胡适运动到批判胡风反革命集团，再到肃清运动，反右运动，拔白旗运动，一场又一场的运动下来，清华大学中的多位老师和负责人被打倒，这其中也包括了副校长钱伟长。
钱伟长和蒋南翔是同乡，但两人的关系却非常一般，钱伟长留学美国，生活方式充满西方的做派，蒋南翔作为一名延安出来的老革命自然非常看不惯，
对于蒋南翔在学校的改革，钱伟长更是有着不同意见，他主张理工合校，打造学术自由，并认为照搬苏联模式，会将清华大学变成一座死气沉沉的囚笼，
他的提议和蒋校长的改造思路完全南辕北辙，正所谓，道不同不相为谋，当时在清华还有一条小道消息流传，说钱伟长会取蒋南翔而代之担任清华校长，对于把清华大学视为自己“一亩三分地”的蒋南翔来说，不允许有人威胁到自己的地位，这种子虚乌有的假消息更能蛊惑人心，所以他和钱伟长只能有一个留在这里。而此时反右运动开始，深谙革命之道的蒋南翔也趁机扳倒了钱伟长。
运动开始之初，钱伟长就被揪出，蒋南翔称：钱伟长是右派中的旗帜，他心里想的和嘴上说的不一样，他最善于煽动蛊惑学生和老师，是学校中著名的两面派，仗着自己的影响力，到处讲课作报告，实际上是让学校所有的人都跟着他走，去搞英美资产阶级那一套，他一边提倡自由化，一边还搞串联，想把我从学校挤走，把清华恢复到过去买办办学那一套，新中国成立这么久，钱伟长却从心里否定苏联模式，否定社会主义，这次运动让他现了原形。
蒋校长发表意见后，曾经很多支持钱伟长合校理论的师生都开始转舵，纷纷跳出来揭发，有人声称受到钱伟长蛊惑，导致自己在大是大非面前动摇，又纷纷向蒋南翔表忠心，发扬痛打落水狗的精神，在墙倒众人推的境况下，钱伟长百口莫辩，被免去一切职务，下放到农村劳动改造，后来又被派遣到北京特种轧钢厂去劳动，右派的帽子一戴就是二十三年，
时光荏苒，在历经了文革的磨难后，两人都重新出来工作，可仍然芥蒂很深，1983年，华中工学院想请钱伟长去担任院长，却被钱伟长一口拒绝，他说“那个学校是蒋部长的管辖区，我怎么可能去那里呢”由此可见两人的隔膜，直到两人去世，也未能解开这段恩怨。
热门跟贴