近日，北京林业大学、中国科学院及国内多家学术机构的研究团队共同发布了叶片衰老数据库第五版（Leaf Senescence Database, LSD v5.0），研究工作刊载在Journal of Molecular Biology。
LSD自2010年创建以来，不断进行更新以紧跟植物衰老研究领域的最新进展，研究工作相继发表在Nucleic Acid Research（LSD v1.0, 2011；LSD v2.0, 2014；LSD v3.0, 2020）和Molecular Horticulture (LSD v4.0, 2022)。当前版本包含了来自148种不同物种的31,740个衰老相关基因（Senescence-Associated Gene, SAG）和1,209个突变体信息，涵盖了从模式植物拟南芥到水稻、杨树等C3植物，再到玉米、高粱等C4植物以及落叶生根等CAM植物。
LSD作为目前唯一专注于叶片衰老领域的专业数据库，通过比较生物学方法，揭示了不同植物物种间叶片衰老过程的进化特征及其潜在规律。所有数据均基于扎实的实验证据经过人工筛选和分类，有助于深入理解这些基因在叶片衰老过程中的具体功能。同时，该研究借鉴哺乳动物衰老研究中的对比分析思路，揭示了基因调控对植物和可能的人类衰老过程的影响，并以模式生物拟南芥为例，进一步印证了其在预测人类衰老相关基因功能方面的巨大潜力。
LSD v5.0不仅展示了海量精心整理的数据，而且致力于未来持续的数据收集和注解工作，计划发掘已全基因组测序植物中的潜在SAGs，优化用户体验，增加包含实例研究的帮助文档，与其他相关网站建立更多链接，确保数据库内容与时俱进，始终处于叶片衰老研究领域的最前沿。数据库还提供了丰富的检索工具，如文本搜索接口，让用户能根据基因座名、关键词和作者名称轻松查询相关信息；所有SAGs的核酸和蛋白质序列均可免费下载，配套在线的用户指南、教程和常见问题解答，确保用户能高效利用这一数据库。
北京林业大学生物科学与技术学院研究生赵亚宁、李诗纯和中国科学院北京基因研究所博士生张阳为论文共同第一作者，北京林业大学生物科学与技术学院李中海教授与中国科学院北京基因组研究所章张研究员为共同通讯作者。这项工作得到国家自然科学基金、北京市自然科学基金、国家重点研发计划以及其他多项人才引进项目的大力支持。衷心感谢LSD用户的宝贵建议和反馈，这些都极大地促进了数据库的建设和完善。
数据库链接：
https://ngdc.cncb.ac.cn/lsd/
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