本研究旨在阐明我国全人群急性呼吸道感染（ARI）病例中人冠状病毒229E（HCoV-229E）的感染情况及病毒基因特征。通过对2009-2021年间中国十一省份15,335例ARI监测病例中HCoV-229E核酸阳性病例进行描述性流行病学分析，发现共316例HCoV阳性病例，其中38例为HCoV-229E阳性。检出率在不同季节中差异无统计学意义；男性检出率高于女性；不同年龄组中，5~17岁青少年组未检测到HCoV-229E，其他年龄组间检出率差异无统计学意义。在38例HCoV-229E阳性病例中，有23例（60.53%）为混合感染病例，与单一感染相比，下呼吸道感染病例比例增高。

此外，通过S基因扩增和测序，及其系统发育和进化分析表明，全球HCoV-229E序列可划分为6个组（Genogroup 1~6），展示了明显的时间聚集性。Genogroup 6为目前全球流行的主要优势谱系，本研究所得9条HCoV-229E序列均隶属于Genogroup 6，但位于不同分支。S基因分子进化速率约为7.32×10-4替换/位点/年，S蛋白处于负向选择压力下，但仍有个别正向选择位点存在。研究结果为我国HCoV-229E感染的控制与预防提供了基线数据，并丰富了对HCoV-229E流行病学特征和病毒分子进化特点的认识。

本研究的结论体现了对HCoV-229E在我国的流行情况及其病毒基因特征的全面分析，对于未来的预防控制策略制定提供了重要的科学依据。通过深入分析HCoV-229E的流行病学特征及其分子进化，可以更好地理解病毒的传播和变异，为疫苗开发和公共卫生干预措施的制定提供参考。

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