记者从西部(重庆)科学城种质创制大科学中心获悉,国家柑橘品种改良中心研制的柑橘液相育种芯片日前获得国家发明专利授权。
育种芯片是生物育种体系中种质资源基因型检测的重要工具,在农作物遗传改良与育种研究中发挥重要作用。为提高柑橘育种效率、加快柑橘育种进程,开发一款经济、高效的基因分型芯片十分必要。
该科研团队研究员陈善春、何永睿和副教授李强等成员以国家柑橘种质资源圃300多个代表性柑橘品种为材料,通过深度重测序筛选出4万余个核心SNP位点。同时,加入了数千个与柑橘重要性状紧密关联的SNP位点,利用博瑞迪生物的靶向捕获技术开发了柑橘全基因组40K液相育种芯片橘芯1号。
据介绍,橘芯1号液相育种芯片的位点检出率大于96%,能够针对同一个SNP位点进行多次检测,变异位点鉴定的准确性相比传统的固相芯片更高;液相芯片的基因分型成本仅为传统固相芯片的十分之一,能够低成本、高通量地进行柑橘基因分型,进一步为资源鉴定、全基因组关联、遗传分析等提供基因组学资源。
陈善春说,橘芯1号液相芯片的使用将为开展柑橘生物育种,开发柑橘全基因组选择育种平台打下基础,有助于提高育种效率,在培育高产、优质的柑橘新品种方面具有巨大的应用前景。(记者吴燕霞)
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