轮状病毒（Rotavirus，RVA）是导致5岁以下婴幼儿急性胃肠炎的主要病原体之一。本文旨在分析我国一例罕见的G9P[8]-A2基因型重配株RVA（JL18221140）的全基因组分子特征。

方法

研究采用从中国吉林省采集的G9P[8]基因型RVA原始粪便标本，利用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增其11个基因节段，并使用DNAStar和MEGA 11.0等生物信息分析软件进行同源性及系统发育分析。

结果

  • 基因型分析：该病毒的全基因组11个节段基因型为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A2-N1-T1-E1-H1，其中NSP1基因型呈现DS-1样特征。

  • 系统发育分析：VP7和VP4基因分别聚集在谱系G9-VI和P[8]-Ⅲ中。与其他中国毒株的核苷酸和氨基酸同源性均在99.00%以上。

  • 重配来源：该罕见重配株可能由中国流行的G9P[8]-A1和G2P[4]-A2毒株在共感染过程中基因组重配产生。

结论

JL18221140是一种罕见的G9P[8]-A2重配株，其基因组特性表明对RVA进行持续监测和全基因组测序的重要性。这为理解中国RVA毒株的遗传变异、病毒防控和疫苗研发提供了基础数据。

本研究首次报道了我国G9P[8]-A2基因型重配株的全基因组分子特征，强调了对RVA毒株的全面监测和研究的重要性，为今后病毒防控和疫苗研发提供了关键数据和科学依据。

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