在母公司为子公司代付款项这种情况中，发票应该开给母公司哦。

因为实际付钱的是母公司嘛，从税务和财务规范的角度来说，发票得跟着资金流向和实际交易主体走。

要是跟子公司签合同却把发票开给子公司，那就会出现资金流和发票流不一致的情况，这在税务检查的时候可能会惹麻烦，而且在财务核算上也不好准确反映实际的业务往来呢。

当母公司代子公司付款时，有一些手续要办。

子公司得弄个付款委托书，写明委托母公司代付款的金额、收款方信息还有付款原因等，盖上子公司公章，法定代表人签字确认。

母公司和子公司内部也都得走审批流程，保证付款符合公司规定。

双方还得在财务账上记好这笔交易，注明是母公司代付。

另外，子公司要通知收款方母公司代付款的情况，签合同的时候最好也约定一下母公司在特定情况下能代子公司付款。

从税务处理来说，在增值税方面，发票抬头得跟实际付款方和货物或劳务接受方一致，不然进项税额可能没法抵扣。

企业所得税方面呢，如果母公司为子公司付款没合理的商业目的和经济实质，可能会被税务机关认为是不合理的关联方交易，要进行纳税调整。

但要是能证明付款是因为合理的业务需要，比如子公司资金困难，母公司为维持子公司正常经营付款，而且有还款计划和利息约定，那就可以作为关联方借款处理，在一定条件下利息支出能在企业所得税前扣除。