瑞典卡罗琳医学院于 10 月 7 日宣布,将 2024 年诺贝尔生理学或医学奖授予科学家 Victor Ambros(维克托·安布罗斯)和 Gary Ruvkun(加里·鲁夫昆),以表彰他们 「发现微小 RNA(microRNA)及其在后转录基因调控中发挥的作用」。他们的发现为我们理解基因调控机制提供了全新的视角,获奖可谓是实至名归。

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Victor Ambros(维克托 · 安布罗斯)和 Gary Ruvkun(加里 · 鲁夫昆)共同获得2024 年诺贝尔生理学或医学奖。

图片来源:诺贝尔奖官网

热知识:

这已经是 RNA 分子研究领域的第四个诺贝尔奖。

2006 年诺贝尔生理学或医学奖——RNA 干扰(RNAi)机制

2020 年诺贝尔化学奖——CRISPR-Cas9 基因编辑技术

2023 年诺贝尔生理学或医学奖——核苷碱基修饰方面研究使得 COVID-19 mRNA 疫苗得以开发

2024 年诺贝尔生理学或医学奖——发现 microRNA 及其在后转录基因调控中发挥的作用

RNA 研究的浪潮正以不可阻挡之势席卷整个生命科学领域。

microRNA——新型基因调控分子

microRNA(miRNA)是一类由内源基因编码的 19-25 个核苷酸长的非编码单链 RNA 分子,在动植物中参与调控基因的转录后表达,第一个 miRNA 自 1993 年在突变秀丽隐杆线虫中被发现[1-2],然而,miRNA 的一般调控功能直到 2001 年才被充分认识。目前,已经在不同物种中鉴定出数千种 miRNA,其生物合成途径如下[3]:

1) 转录:miRNA 基因在细胞核内首先被 RNA 聚合酶 II(Pol II)转录成初级 miRNA(pri-miRNA),这是一段较长的 RNA 分子。

2) 切割:pri-miRNA 随后被「微处理器」复合体(包含 DROSHA 和 DiGeorge 综合征关键区域 8 蛋白,DGCR8)切割,产生大约 60-70 个核苷酸的发夹结构前体 miRNA(pre-miRNA)。

3) 转运:pre-miRNA 由 exportin 5(XPO5)从核内运输到细胞质中。

4) 成熟:在细胞质中,pre-miRNA 被 DICER 酶进一步加工,产生成熟的 miRNA。

5) 功能:成熟的 miRNA 中的一条链(引导链)被加载到 miRNA 诱导的沉默复合体(miRISC)中,该复合体包含 DICER1 和 Argonaute(AGO)蛋白。miRISC 通过序列互补结合靶向 mRNA,并在处理体(P-bodies)中通过靶向 mRNA 的降解和翻译抑制来介导基因抑制。

miRNA 的这一生物合成途径在动植物中具有保守性,尽管在某些细节上可能存在差异。例如,在植物中,miRNA 的生物合成也涉及类似的步骤,但可能在特定的调控机制和蛋白质因子方面有所不同[4]。

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microRNA的合成与作用机制图[4]

microRNA 的应用与研究前景

自从 miRNA 被发现以来,就因其在基因调控中的重要作用而受到广泛关注。miRNA 通过影响目标基因的转录后调控和基因沉默等机制,参与了细胞生长、分化、发育和凋亡等一系列关键生物过程。在动物领域的相关研究包括:发育和细胞分化、细胞凋亡、 脂类代谢、激素分泌、内源基因表达调控、疾病发生机制、疾病预测与诊断、肿瘤发生机理、病毒的免疫防御机制等,而在植物领域,miRNA 的研究包括:植物胚胎和分生组织发育、叶和花的遗传发育、核酸水平调控、病毒抵抗防御机制等。

miRNA 的这些功能和研究应用领域,不仅揭示了其在生物体中的重要角色,也为未来的治疗策略和生物技术应用提供了广阔的前景。

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microRNA 应用领域

microRNA 研究方法与高通量测序

研究 miRNA 的基本方法通常包括以下步骤:

1) 表型 miRNA 鉴定:基于高通量测序或已发表的文献,确定与特定表型相关的 miRNA;

2) miRNA 靶基因预测:利用生物信息学工具,如 Targetscan、miRDB 或 PicTar,预测 miRNA 的潜在靶基因;或者通过查阅相关文献,筛选出与研究表型相关的 miRNA 和靶基因,以提高实验的成功率;

3) miRNA 实验验证:通过双荧光素酶报告基因的实验验证 miRNA 与靶基因的靶向关系;

4) 研究 miRNA 的功能

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miRNA 研究策略基本思路导图

高通量测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)在 miRNA 的研究中扮演着至关重要的角色,可以帮助科学家深入分析样本中的 miRNA,识别并定量已知的 miRNA,发现新型有研究潜力的 miRNA。通过对原始数据进行质量控制、序列比对、差异表达分析和靶基因预测等,研究人员可以揭示 miRNA 的生物合成、功能和调控机制,以及它们在各种生物学过程中的作用。

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小 RNA 分类注释

miRNA 与靶基因

互作网络图

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miRNA 靶基因的 KEGG 通路注释分类统计图

聚类表达热图

更多 RNA 产品亮点

01

真核转录组测序

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长链非编码 RNA 测序

技术稳定性超高,同一样本重复建库相关性大于 0.993;

性价比高,一次测序可以得到 mRNA、lncRNA、circRNA 信息;

样本处理经验丰富,已完成万例 lncRNA 样本。

参考文献:

[1] Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14. Cell. 1993;75(5):843-854.

[2] Wightman B, Ha I, Ruvkun G. Posttranscriptional regulation of the heterochronic gene lin-14 by lin-4 mediates temporal pattern formation in C. elegans. Cell. 1993;75(5):855-862.

[3] Lin S, Gregory RI. MicroRNA biogenesis pathways in cancer. Nat Rev Cancer. 2015 Jun;15(6):321-33.

[4] Ha M, Kim VN. Regulation of microRNA biogenesis. Nat Rev Mol Cell Biol. 2014 Aug;15(8):509-24.

内容审核:潘成

项目审核:朱超敏

题图来源:诺贝尔奖官网