1661年，郑成功从荷兰侵略者手里收复台湾，台湾历史进入一个短暂的特殊时期——郑氏时代，即在清朝初年台湾被郑氏家族统治的时代。想要明白这段历史，就不得不从从民族英雄郑成功说起。
郑成功，福建南安人，祖籍河南，其父郑芝龙一开始是活动于中国与日本之间的海商兼海盗，明朝末年天下大乱之时，郑芝龙趁机建立了一支强大的私人海军。后来，明朝招抚了无力剿灭的郑芝龙，崇祯自缢后，南明弘光帝为了进一步拉拢郑芝龙，册封其为南安伯、福建总镇。
清军入关南下之际，郑成功随父亲率军在东南沿海开展反清复明的军事斗争，并且成为后来南明朝廷的主要依靠。但不久后，其父郑芝龙投降了清军，郑成功却不改心头之志，仍然坚持反清复明，率残部辗转于东南沿海和沿海岛屿之间。但是清政府一个政策，却极大地打击了郑成功的反清势力。
为了消弭东南沿海的反清势力和减少倭寇之患，清政府不仅继续实行明太祖朱元璋就开始的“禁海令”，而且在此基础上又颁布“迁海令”，即下令东南沿海的居民一律内迁60海里，同时限制对外的海上贸易。由此一来，郑成功的势力由于得不到沿海城市的物资供给实力大大缩减。为了解决这一困境，郑成功将眼光投向了台湾岛，打算将台湾岛作为反清复明的据点。而此时台湾岛正被荷兰侵略者所占领，于是郑成功便开始了轰轰烈烈的收台运动。
1661年，郑成功派其子留守厦门，亲率大军进攻台湾岛，并于1662年成功赶走了岛上的荷兰侵略者，流落在外三十多年的台湾岛终于光复。
占领台湾后，郑成功立即建立政权，颁布了一系列的政治经济和军事措施，经济上发展农业，奖励开拓荒地；政治上废除了荷兰人设立的官僚体系和政府机构，设立大陆传统的府县制度；在民族关系上，郑成功实行宽容的民族包容政策，下令所有士卒不能干扰当地民众的正常生活。台湾正式开始了自己的郑氏时代。
但是在1663年，也就是收复台湾的第二年，郑成功因病去世，其子郑经继续执掌台湾政权。值得注意的是，此时大陆已经完成了新旧政权的交替，清政府在大陆的统治已然稳固。郑氏家族作为一个反抗清政府统治的势力，对台湾的占领必然引起清政府的不满。
台湾自古以来都是中国的领土，在大陆统治日渐稳固的清政府，也想将台湾重新纳入王朝正统的统辖，并多次对台湾的郑氏王朝进行招抚，但是都被拒绝了，清朝政府只得率军以武力攻占台湾。1683年，清军攻占澎湖列岛，郑氏家族投降，清军完成了对台湾岛的占领，台湾历史上延续了22年的郑氏时代也宣告结束。
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