“皖南事变”后，新四军军部迅速重建，陇海线以南的八路军、新四军部队全部编入新四军，整编为七个师又一个独立旅，其中长江以南的江南指挥部、江南人民抗日救国军等编为新四军第六师。

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新四军第六师成立时，辖第十六旅、十八旅两个旅，总兵力八千余人，是坚持苏南抗战的主力，师长为谭震林，谭震林也兼任政治委员，参谋长罗忠毅，政治部主任何克希。

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新四军第六师第十六旅，由新江南指挥部及所辖部队编成（曾短暂称新第二支队），旅长由罗忠毅兼，政治委员兼政治部主任廖海涛，参谋长为王胜。

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第十六旅编成后一直活动于茅山根据地，1941年11月日军突袭第十六旅及苏皖区驻地溧阳塘马村，罗忠毅、廖海涛等牺牲，十六旅遭受重大损失。此战后，黄玉庭、钟国楚分别短暂代理旅长、政治委员，不久谭震林到溧水整顿部队，亲自兼任旅长，政治委员为钟国楚。

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新四军第六师第十八旅，由江南人民抗日救国军东路指挥部（曾短暂称新第三支队）编成，旅长为江渭清，政治委员温玉成，参谋长夏光，政治部主任张英。

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十八旅成立后，主要活动于苏南东路（苏锡常等地），由于日伪军大规模清乡，十八旅损失较大，1941年8月北渡长江，10月进入高邮、宝应等地区归新四军第一师指挥。

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新四军第六师及两个旅主要领导成员中，罗忠毅、廖海涛等牺牲，温玉成为开国中将，何克希、王胜、张英三位为开国少将，谭震林、江渭清、夏光三位未授衔。

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两位旅长均未能授衔，一牺牲一转为地方行政工作，新四军第六师也是新四军七个师中撤销番号最早的一个师。