微生物限度检查中的平皿法和薄膜过滤法是常用的两种方法，它们各有特点和适用范围，具体优缺点分析如下：

平皿法

优点

操作相对简单：不需要特殊的设备，操作过程直观易懂。

可同时检测多种微生物：由于是将供试品溶液均匀地涂布在琼脂培养基表面，因此可以同时检测到多种微生物的生长情况。

缺点

受抑菌成分影响：对于含有抑菌成分的供试品，可能会抑制微生物的生长，导致检测结果偏低。

不适用于微生物含量较低的供试品：由于微生物在培养基上的生长和繁殖需要一定的时间，因此微生物含量较低的供试品可能无法在短时间内形成明显的菌落，从而影响检测的准确性。

薄膜过滤法

优点

适用范围广：适用于各类样品，尤其对过滤大颗粒及黏性样品具有优越性。能够有效地将微生物截留在滤膜上，与样品中的其他成分分离，减少了杂质对检测结果的干扰，适用于成分复杂的样品。

集菌效率高：尤其适用于黏性、易堵塞的样品，过滤时间短，一般在30分钟左右。

去除抑菌成分：通过冲洗滤膜可以去除供试品中的抑菌成分，提高检测的准确性。

高准确性：滤膜的大小和形状规则，有利于菌落的观察和计数，准确反映样品中微生物的实际数量。

可浓缩微生物：过滤过程可以对微生物起到浓缩的作用，即使样品中微生物含量较低，也能通过过滤和后续培养进行检测，提高了检测的灵敏度。

缺点

操作相对复杂：需要特殊的过滤装置，且操作过程相对繁琐，需要一定的技术水平和经验。

滤膜选择要求高：不同类型的样品需要选择合适孔径和材质的滤膜，否则可能会影响过滤效果和微生物的截留率。

存在滤膜堵塞风险：如果样品中含有较多的颗粒物质、黏稠物质或大分子物质，可能会堵塞滤膜，影响过滤的进行。

设备依赖性强：需要使用专门的微生物限度检查仪或过滤装置，设备的性能和状态对检测结果有较大影响。

无法检测部分微生物：对于一些不适用过滤法分离的病毒、立克次氏体和衣原体等微生物无法检测。

检测结果受操作人员技术水平影响较大：由于操作过程相对复杂，需要经验丰富的专业人员进行操作，以确保检测结果的准确性和可靠性。

综上所述，平皿法和薄膜过滤法在微生物限度检查中各有优缺点，应根据供试品的特点和检测要求选择合适的方法。