40篇！中国学者2024年Nature Chemcial Biology论文发表汇总|biology|rna|发表汇总|活性|线粒体|细胞|蛋白|论文

编者按

2024年度，中国学者在Nature Chemcial Biology杂志发表40篇研究论文。同比上一年度的34篇，增幅17.6%。

2024年度中国生命科学Nature Chemcial Biology合集列表

（说明：按在线时间先后顺序列表，部分署名国外单位为主兼署国内单位的论文不计入，国内作者为共同通讯作者的论文计入）

Weng, Y., W. Chen, Q. Kong, R. Wang, R. Zeng, A. He, Y. Liu, Y. Mao, Y. Qin, W. S. C. Ngai, H. Zhang, M. Ke, J. Wang,R. TianandP. R. Chen(2024). "DeKinomics pulse-chases kinase functions in living cells."Nature Chemical Biology20(5): 615-623.（20240102，北京大学，陈鹏课题；南方科技大学，田瑞军）报道了一种基于生物正交脱笼和蛋白质组学策略的活细胞激酶“脉冲追踪”技术（Decaging Kinase coupled proteomics，DeKinomics），实现了高时间分辨的激酶信号转导原位解析。（）
Zhang, S., D. Ma, K. Wang, Y. Li, Z. Yang, X. Li, J. Li, J. He, L. Mei, Y. Ye, Z. Chen, J. Shen, P. Hou,J. Guo, Q. ZhangandH. Yang(2024). "A small-molecule activation mechanism that directly opens the KCNQ2 channel."Nature Chemical Biology20(7): 847-856.（20240102，华东师范大学，阳怀宇，张乾森；浙江大学，郭江涛）报道了增加KCNQ2通道电导的新型激动剂，并揭示了小分子直接打开孔道区的新型调控机制。（）
Qin, M., E. Geng, J. Wang, M. Yu, T. Dong, S. Li, X. Zhang, J. Lin, M. Shi, J. Li, H. Zhang, L. Chen, X. Cao, L. Huang, M. Wang, Y. Li, X.-p. Yang, B. Zhao andS. Sun(2024). "LATS2 condensates organize signalosomes for Hippo pathway signal transduction."Nature Chemical Biology20(6): 710-720.（20240110，华中科技大学，孙书国）揭示了LATS2如何通过形成凝聚体来稳定自身并促进Hippo信号通路的激活。这为理解细胞信号转导和癌症发生、发展提供了新的视角。（）
Zhang, Z., H. Zhou, W. Gu, Y. Wei, S. Mou,Y. Wang, J. ZhangandQ. Zhong(2024). "CGI1746 targets σ1R to modulate ferroptosis through mitochondria-associated membranes."Nature Chemical Biology20(6): 699-709.（20240111，上海交通大学，钟清，张晶；北京师范大学，王友军）发现线粒体相关内质网膜通过钙离子转运和脂质重塑调节铁死亡发生。（）
Zhang, Q., T. Sun, F. Yu, W. Liu, J. Gao, J. Chen, H. Zheng, J. Liu, C. Miao, H. Guo, W. Tian, M. Su, Y. Guo, X. Liu, Y. Pei, Z. Wang, S. Chen, C. Mu, S. M. Lam, G. Shui, Z. Li, Z. Yu, Y. Zhang, G. Chen, C. Lu, A. C. Midgley, C. Li, X. Bian, X. Liao,Y. Wang, W. Xiong, H. Zhu, Y. LiandQ. Chen(2024). "PAFAH2 suppresses synchronized ferroptosis to ameliorate acute kidney injury."Nature Chemical Biology20(7): 835-846.（20240129，南开大学，陈佺，李艳君；中国科学技术大学，熊伟，朱洪影；浙江大学，王勇）报道了铁死亡的传播因子和调控机制，发现磷脂酶PAFAH2可以抑制血小板激活因子PAF（platelet activating factor）及其类似物介导的铁死亡传播，从而缓解缺血再灌注导致的肾小管损伤。（）
Hao, M., X. Ling, Y. Sun, X. Wang, W. Li, L. Chang, Z. Zeng, X. Shi, M. Niu, L. Chen andT. Liu(2024). "Tracking endogenous proteins based on RNA editing-mediated genetic code expansion."Nature Chemical Biology20(6): 721-731.（20240201，北京大学，刘涛）首次结合RNA编辑与非经典氨基酸整合技术应用于内源蛋白标记系统，并且可以应用于神经细胞中目标蛋白的标记。
Tong, X., K. Zhang, Y. Han, T. Li, M. Duan, R. Ji, X. Wang, X. Zhou, Y. Zhang andH. Yin(2024). "Fast and sensitive CRISPR detection by minimized interference of target amplification."Nature Chemical Biology20(7): 885-893.（20240208，武汉大学，殷昊）通过深入解析影响基于Cas12b和Cas13a检测性能的分子机制，建立了无需温控装置的CRISPR检测方法，实现了在室温下进行快速且灵敏的检测。（）
Zhou, X., C. Zhao, H. Xu, Y. Xu, L. Zhan, P. Wang, J. He, T. Lu, Y. Gu, Y. Yang, C. Xu, Y. Chen, Y. Liu, Y. Zeng, F. Tian, Q. Chen, X. Xie, J. Liu, H. Hu, J. Li,Y. Zheng, J. GuoandZ. Gao(2024). "Pharmacological inhibition of Kir4.1 evokes rapid-onset antidepressant responses."Nature Chemical Biology20(7): 857-866.（20240214，中国科学院上海药物研究所，高召兵，郑月明；浙江大学，郭江涛）揭示钾通道Kir4.1是具有高度治疗和研发价值的新型快速抗抑郁药物靶点，同时该工作提供了一种以胶质细胞为核心的新型抗抑郁干预策略示例。（）
Zeng, X., T. Wei, X. Wang, Y. Liu, Z. Tan, Y. Zhang, T. Feng, Y. Cheng, F. Wang, B. Ma, W. Qin, C. Gao,J. XiaoandC. Wang(2024). "Discovery of metal-binding proteins by thermal proteome profiling."Nature Chemical Biology20(6): 770-778.（20240226，北京大学，王初，肖俊宇）开发了一种名为METAL-TPP的实验方法，采用热稳定性组学分析技术在蛋白质组学水平研究了金属解离诱导的蛋白热稳定性扰动。（）
Li, W., Q. Liu, Y. Qian, C. Wang, C. Kong, L. Sun, L. Sun, H. Liu, Y. Zhang, D. Jiang, C. Jiang, S. Wang andP. Xia(2024). "Adipose triglyceride lipase suppresses noncanonical inflammasome by hydrolyzing LPS."Nature Chemical Biology20(11): 1434-1442.（20240227，北京大学，夏朋延）报道了细胞中存在LPS识别信号的负调控因子ATGL，ATGL能够特异性地水解LPS酰化侧链上的酯键，抑制非经典炎症小体活化。（）
Yang, S., M. Wang, D. Tian, X. Zhang, K. Cui, S. Lü, H.-h. Wang, M. Long andZ. Nie(2024). "DNA-functionalized artificial mechanoreceptor for de novo force-responsive signaling."Nature Chemical Biology20(8): 1066-1077.（20240306，湖南大学，聂舟）报道了一种从头设计的DNA功能化人工机械力受体（AMR），它能够重新编程原本不具备机械力感应功能的细胞表面受体，使其对可人为定义的力刺激信号产生响应。（）
Li, M., Z. Wang, J. Tao, H. Jiang, H. Yang, D. Guo, H. Zhao, X. He, S. Luo, X. Jiang, L. Yuan, L. Xiao, H. He, R. Yu, J. Fang, T. Liang, Z. Mao,D. XuandZ. Lu(2024). "Fructose-1,6-bisphosphatase 1 dephosphorylates and inhibits TERT for tumor suppression."Nature Chemical Biology20(11): 1505-1513.（20240327，浙江大学，吕志民，许大千）揭示了代谢酶FBP1调控端粒长度与细胞衰老决定肿瘤生长的新机制。（） Yang, L., Y. Huo, M. Wang, D. Zhang, T. Zhang, H. Wu, X. Rao, H. Meng, S. Yin, J. Mei, D. Zhang, X. Chen, J. Lv, M. Liu, Y. Cheng, Y. Guan, B. Feng, G. Song, C. Yi, M. Liu,F. Zeng, L. WangandD. Li(2024). "Engineering APOBEC3A deaminase for highly accurate and efficient base editing."Nature Chemical Biology20(9): 1176-1187.（20240329，华东师范大学，李大力，王立人；上海交通大学，曾凡一）报道了三个高精准型的胞嘧啶碱基编辑器haA3A-CBE，在兼顾窄编辑窗口和极低脱靶活性的同时，在甲基化区域和GC序列背景位点表现出显著优势，并通过腺相关病毒或脂质纳米颗粒递送在小鼠体内实现了精准高效编辑。（）
Tian, T., J. Chen, H. Zhao, Y. Li, F. Xia, J. Huang, J. Han andT. Liu(2024). "UFL1 triggers replication fork degradation by MRE11 in BRCA1/2-deficient cells."Nature Chemical Biology20(12): 1650-1661.（20240422，浙江大学，刘婷）发现，在复制压力下，E3连接酶UFL1催化PTIP蛋白发生UFMylation修饰，促进BRCA1/2缺陷细胞中新生DNA链的降解。
Li, Z., Z.-m. Xu, W.-p. Chen, X.-j. Du, C.-x. Ou, Z.-k. Luo, R. Wang, C.-q. Zhang, C.-d. Ge, M. Han, F. Wang, R.-R. He,W.-y. Sun, J. Ma, X.-y. LiangandZ.-w. Liu(2024). "Tumor-repopulating cells evade ferroptosis via PCK2-dependent phospholipid remodeling."Nature Chemical Biology20(10): 1341-1352.（20240508，中山大学，马骏，刘卓炜；暨南大学，何蓉蓉，孙万阳）报道了肿瘤再生细胞通过重塑膜磷脂耐受铁死亡进而抵抗肿瘤放化疗的机制，揭示了线粒体及线粒体代谢酶PCK2在调控肿瘤细胞ACSL4相关磷脂重塑中的关键作用。（）
Yin, Y., Z. Yang, Y. Sun, Y. Yang, X. Zhang, X. Zhao, W. Tian, Y. Qiu,Y. Yin, F. YouandD. Lu(2024). "RNA-binding protein PTENα blocks RIG-I activation to prevent viral inflammation."Nature Chemical Biology20(10): 1317-1328.（20240521，北京大学，吕丹，游富平，尹玉新）发现与经典的PTEN蛋白不同，PTEN家族新成员PTENα不仅影响脂质和蛋白磷酸化水平，还作为RNA磷酸酶，参与调控RIG-I的活化与功能。（）
Zuo, F., L. Jiang, N. Su, Y. Zhang, B. Bao, L. Wang, Y. Shi, H. Yang, X. Huang, R. Li, Q. Zeng, Z. Chen, Q. Lin, Y. Zhuang, Y. Zhao,X. Chen, L. ZhuandY. Yang(2024). "Imaging the dynamics of messenger RNA with a bright and stable green fluorescent RNA."Nature Chemical Biology20(10): 1272-1281.（20240523，华东理工大学，杨弋，朱麟勇，陈显军）发展了活细胞内具有超高亮度和光稳定性的新型绿色荧光RNA，不仅可用于细菌和哺乳动物细胞内mRNA的高亮度、低背景成像，还可用于应激颗粒内不同mRNA分布的超分辨成像，揭示了不同mRNA在颗粒中分布的异质性和不均一性。（）
Huang, K., Q. Song, M. Fang, D. Yao, X. Shen, X. Xu, X. Chen,L. Zhu, Y. YangandA. Ren(2024). "Structural basis of a small monomeric Clivia fluorogenic RNA with a large Stokes shift."Nature Chemical Biology20(11): 1453-1460.（20240530，浙江大学，任艾明；华东理工大学，杨弋，朱麟勇）报道了新型具有大斯托克斯位移的荧光RNA适配体Clivia与染料配体NBSI的晶体结构，揭示了Clivia适配体对染料配体NBSI的识别与荧光激活机制，并基于结构进行多价荧光适配体设计。（）
Du, F., Z. Li, X. Li, D. Zhang, F. Zhang, Z. Zhang, Y. Xu, J. Tang, Y. Li, X. Huang, Y. Gu,X. SunandH. Huang(2024). "Optimizing multicopy chromosomal integration for stable high-performing strains."Nature Chemical Biology20(12): 1670-1679. （20240610，南京师大）
Han, L., Y. Hu, Q. Mo, H. Yang, F. Gu, F. Bai, Y. Sun andH. Ma(2024). "Engineering miniature IscB nickase for robust base editing with broad targeting range."Nature Chemical Biology20(12): 1629-1639.（20240708，上海科技大学，马涵慧）通过工程化改造OgeuIscB-RNA系统并融合DNA双链结合蛋白Sso7d开发了高效的微型碱基编辑器-SIminiBEs。SIminiBEs显示了强大的C到T或A到G的碱基转换能力，并表现出广泛的靶向范围，近乎不受靶向位点限制。（）
Zhang, L., H. Wang, J. Zeng, X. Cao, Z. Gao, Z. Liu, F. Li, J. Wang,Y. Zhang, M. YangandY. Feng(2024). "Cas1 mediates the interference stage in a phage-encoded CRISPR–Cas system."Nature Chemical Biology20(11): 1471-1481.（20240708，北京化工大学，冯越；清华大学，杨茂君）报道了ICP1噬菌体CRISPR-Cas系统独特的借助Cas1蛋白招募Cas2/3降解靶DNA的分子机制。（）
Zhang, D., J. Gao, Z. Zhu, Q. Mao, Z. Xu, P. K. Singh, C. C. Rimayi, C. Moreno-Yruela, S. Xu, G. Li, Y.-C. Sin, Y. Chen, C. A. Olsen, N. W. Snyder,L. Dai, L. LiandY. Zhao(2025). "Lysine l-lactylation is the dominant lactylation isomer induced by glycolysis."Nature Chemical Biology21(1): 91-99.（20240719，北京大学，张迪；四川大学，戴伦治；威斯康星大学，李灵军；芝加哥大学，赵英明）采用了正交的技术区分了三种赖氨酸乳酰化修饰的同分异构体，并确立了L-乳酰化修饰在细胞响应糖酵解过程和Warburg效应中的核心作用。（）
Peng, Z., W. Fang, B. Wu, M. He, S. Li, J. Wei, Y. Hao, L. Jin, M. Liu, X. Zhang, Y. Wei, Y. Ge, Y. Wei, H. Qian, Y. Zhang, J. Jiang, Z. Chang,Y. Rao, X. Zhang, C.-P. CuiandL. Zhang(2025). "Targeting Smurf1 to block PDK1–Akt signaling in KRAS-mutated colorectal cancer."Nature Chemical Biology21(1): 59-70.（20240722，国家蛋白质科学中心，张令强，崔春萍；清华大学，饶燏；南方医科大学，张学利）揭示了E3连接酶SMAD泛素化调节因子1 (Smurf1)介导的磷酸肌苷依赖性蛋白激酶1 (PDK1)拟素化修饰在PI3K-Akt信号传导和肿瘤发生中的重要作用。
Wu, J., J. Zhou, G. Li, X. Sun, C. Xiang, H. Chen andP. Jiang(2024). "Metabolic determinants of germinal center B cell formation and responses."Nature Chemical Biology.（20240726，清华大学，江鹏）揭示了高水平的核苷酸合成和氧化还原平衡能力是 GC B 细胞形成和反应所必需的，从而揭示了决定GC B 细胞命运的代谢基础和关键生化因素。（）
Zhu, Y., X. Tong, J. Xue, H. Qiu, D. Zhang, D.-Q. Zheng, Z.-C. Tu andC. Ye(2025). "Phospholipid biosynthesis modulates nucleotide metabolism and reductive capacity."Nature Chemical Biology21(1): 35-46.（20240726，浙江大学，叶存奇）强调了磷脂合成能够整合对核苷酸代谢、氧化还原平衡以及膜生物物理特性的调节能力，并以此在细胞防御中发挥关键作用。（）
Shu, X.,R. Wang, Z. Li, Q. Xue, J. Wang, J. Liu, F. Cheng, C. Liu, H. Zhao, C. Hu,J. Li, S. OuyangandM. Li(2024). "CRISPR-repressed toxin–antitoxin provides herd immunity against anti-CRISPR elements."Nature Chemical Biology.（20240729，中国科学院微生物所，李明，李洁，王锐；福建师范大学，欧阳松应）阐释了一种不基于序列识别的群体免疫机制，拓展了对CRISPR免疫策略的理解。
Gan, L., Q. Jiang, D. Huang, X. Wu, X. Zhu, L. Wang, W. Xie, J. Huang, R. Fan, Y. Jing, G. Tang, X. D. Li,J. GuoandS. Yin(2025). "A natural small molecule alleviates liver fibrosis by targeting apolipoprotein L2."Nature Chemical Biology21(1): 80-90.（20240805，中山大学，尹胜，郭剑平）以抗肝纤维化活性为导向，对大戟科二萜类化合物库进行了高内涵筛选，获得一个在体内外具有强效抗肝纤维化活性的惕各烷型二萜小分子DP，通过化学生物学手段发现和证实其直接作用靶点为Apolipoprotein L2（APOL2），并首次揭示了APOL2为治疗肝纤维化的潜在新靶点。（）
Zhang, Y., Y. Cai, X. Jin, Q. Wu, F. Bai andJ. Liu(2024). "Persistent glucose consumption under antibiotic treatment protects bacterial community."Nature Chemical Biology.（20240813，清华大学，刘锦涛，张玉针）揭示了细菌对抗生素产生群体抗性的新机制，为开发针对细菌群体的抗生素治疗策略提供了新方向）
Xiao, Q., G. Li, D. Han, H. Wang, M. Yao, T. Ma, J. Zhou, Y. Zhang, X. Zhang, B. He, Y. Yuan, L. Shi,T. Li, H. Yang, J. HuangandH. Zhang(2024). "Engineered IscB–ωRNA system with expanded target range for base editing."Nature Chemical Biology.（20240815，辉大基因，张海南，李彤；复旦大学，黄锦海；中科院脑科学与智能技术卓越创新中心，杨辉）通过对新型IscB的挖掘和优化改造，开发出靶向范围更广的高活性、高特异性的迷你型碱基编辑工具IscB.m16*-BE，在基于AAV的基因治疗应用中显示出独特的优势和巨大的潜力。（）
Tang, C., L. Wang, J. Sun, G. Chen, J. Shen, L. Wang, Y. Han, J. Luo, Z. Li, P. Zhang, S. Zeng, D. Qi, J. Geng, J. Liu andZ. Dai(2024). "Degradable living plastics programmed by engineered spores."Nature Chemical Biology.（20240821，中国科学院深圳先进技术研究院，戴卓君）通过对微生物进行基因编辑并产生具备极端环境耐受能力的孢子，使其可以在特定条件下分泌塑料降解酶；并通过塑料加工方法（高温、高压或有机溶剂）将孢子包埋在塑料基质中。（）
Cao, C., A. Li, C. Xu, B. Wu,L. YaoandY. Liu(2024). "Engineering artificial non-coding RNAs for targeted protein degradation."Nature Chemical Biology.（20240830，深圳大学，刘宇辰；北京大学，姚林）创新性地提出了人工长链非编码RNA（alncRNA）技术，能够精确靶向并高效降解蛋白质，有效解决了长期以来困扰科学界的“难以成药”靶点问题。（）
Dang, T., J. Yu, Z. Cao, B. Zhang, S. Li, Y. Xin, L. Yang, R. Lou,M. ZhuangandW. Shui(2024). "Endogenous cell membrane interactome mapping for the GLP-1 receptor in different cell types."Nature Chemical Biology.（20240903，上海科技大学，水雯箐，庄敏）发展了基于配体的邻近标记技术，实现对内源表达的GLP-1R的互作蛋白质组的特异标记、组学鉴定与动态调控分析。（）
Lu, K., B. Luo, X. Tao, Y. Luo, M. Ao, B. Zheng, X. Xu, X. Ma, J. Niu, H. Li, Y. Xie, Z. Zhao, P. Zheng, G. Wang, S. Gao, C. Wang,W. Xia, Z. SuandZ.-W. Mao(2024). "Complex structure and activation mechanism of arginine kinase McsB by McsA."Nature Chemical Biology.（20240904，中山大学，毛宗万，夏炜；四川大学，苏昭铭）首次报道了金黄色葡萄球菌的McsA-McsB复合物的冷冻电镜结构，有助于深入研究细菌在热压力下如何利用磷酸化动态修饰维持蛋白质稳态，为抗菌治疗提供新的思路和理论依据。
Wang, S., M. Liu, D. Hu, Z. Dong andZ. Zhao(2024). "Control of DNA demethylation by superoxide anion in plant stem cells."Nature Chemical Biology.（20240912，中国科学技术大学，赵忠）解析了超氧根信号传递和决定真核生物干细胞命运的分子机制。
Li, G., Y. Cheng, J. Yu, Y. Zhu, H. Ma, Y. Zhou, Z. Pu, G. Zhu, Y. Yuan, Z. Zhang, X. Zhou, K. Tian, J. Qiao, X. Hu,X.-x. Chen, Q. Ji, X. Huang,B. MaandY. Yao(2024). "Compact RNA editors with natural miniature Cas13j nucleases."Nature Chemical Biology.（20240919，浙江大学，姚远，马斌，陈学新，李果）通过对土壤微生物大规模宏基因组数据进行智能挖掘，发现一个可高效靶向切割RNA的极小型Cas13j蛋白家族，蛋白大小为424 aa，是迄今已报道的自然界最小的CRISPR-Cas13系统。（）
Li, Y., T. Xu, H. Ma, D. Yue, Q. Lamao, Y. Liu, Z. Zhou andW. Wei(2024). "Functional profiling of serine, threonine and tyrosine sites."Nature Chemical Biology.（20240923，北京大学，魏文胜）利用腺嘌呤碱基编辑器对全基因组范围内的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点进行靶向编辑，并在人类视网膜色素上皮细胞系（RPE1）中进行了细胞筛选，成功鉴定出3,467个功能性氨基酸位点。（）
Niu, H.,M.-Y. Li, Y. Gao, J.-G. Li, J. Jiang, Y.-L. Ying andY.-T. Long(2024). "Direct mapping of tyrosine sulfation states in native peptides by nanopore."Nature Chemical Biology.（20240925，南京大学，李孟寅，龙亿涛）报道了一种基于纳米孔道单分子电化学技术的酪氨酸硫酸化蛋白质检测方法，成功实现对天然蛋白上酪氨酸硫酸化位置图谱的绘制及其所在片段氨基酸序列的精准鉴定。
Ai, H., Z. Tong, Z. Deng, Q. Shi, S. Tao, G. Sun, J. Liang, M. Sun, X. Wu, Q. Zheng, L. Liang, H. Yin, J.-B. Li, S. Gao,C. Tian,L. LiuandM. Pan(2024). "Mechanism of nucleosomal H2A K13/15 monoubiquitination and adjacent dual monoubiquitination by RNF168."Nature Chemical Biology.（20241011，上海交通大学，潘漫，田长麟；清华大学，刘磊）报告了RNF168对核小体H2A K13/15单泛素化和邻近双泛素化的分子机制。
Zhang, Y.-W., J.-J. Yang, F.-H. Qian, K. B. Sutton, C. Hjort, W.-P. Wu, Y. Jiang andS. Yang(2024). "Engineering a xylose fermenting yeast for lignocellulosic ethanol production."Nature Chemical Biology.（20241104，中国科学院分子植物科学卓越创新中心，杨晟）该研究开发了一株能高效利用秸秆糖的酵母并揭示其高产机制，已用于商业化生产纤维素乙醇。
Hao, Y., Z. Zhou, R. Liu, S. Shen, H. Liu, Y. Zhou, Y. Sun, Q. Mao, T. Zhang, S.-T. Li, Z. Liu, Y. Chu,L. Sun, P. GaoandH. Zhang(2024). "Mitochondria-localized MBD2c facilitates mtDNA transcription and drug resistance."Nature Chemical Biology.（20241128，中国科学技术大学，张华凤；南方医科大学，高平，孙林冲）发现线粒体中的MBD2c通过促进线粒体基因转录增强乳腺癌细胞对化疗药物顺铂的耐药性。（）