中国人民解放军海军平时实行作战指挥与建设管理合一的领导体制。共分为五大兵种：海军水面舰艇部队、海军潜艇部队、海军航空兵、海军陆战队、海军岸防部队。海军水面舰艇部队编有战斗舰艇部队和勤务舰船部队。

2016年改革后，中国人民解放军海军领导管理下列机构和直属单位：

职能部门

  • 参谋部

  • 政治工作部

  • 后勤部

  • 装备部

  • 纪律检查委员会（监察委员会）

战区海军机关

  • 南部战区海军（南海舰队）

  • 东部战区海军（东海舰队）

  • 北部战区海军（北海舰队）

兵种机关

  • 中国人民解放军海军陆战队

直属单位

  • 中国人民解放军海军试验基地

  • 中国人民解放军海军舰载机综合试验训练基地

  • 中国人民解放军驻吉布提保障基地

  • 中国人民解放军海军研究院

直属院校

  • 中国人民解放军海军指挥学院

  • 中国人民解放军海军工程大学

  • 中国人民解放军海军航空大学

  • 中国人民解放军海军军医大学

  • 中国人民解放军海军大连舰艇学院

  • 中国人民解放军海军潜艇学院

  • 中国人民解放军海军勤务学院

  • 中国人民解放军海军士官学校