1968年，刘懋功临危受命被任命南京军区空军司令，一家人离开工作多年的昆明。

搬到南京后，妻子余群又回到昆明，办一下工作调动的手续，结果被定为“叛徒”。这是源于余群过去做过地下工作，曾被俘过。在出狱后，也经过组织审查，对方是没有任何问题的。如今被造反派一方拿出来说有问题，下放到农村劳动改造。

为不影响丈夫与子女，主动断绝联系。

他与妻子余群是在抗战时期相识相恋走到一起，妻子是1936年参加革命，两人认识之前，余群是关中地委妇联副主任。刘懋功对人家是一见钟情，经过一段时间接触后，刘懋功向余群表达结婚的愿望，得到同意，简单举行婚礼。

此后的几十年，两人一个在前线一个在后方，相濡以沫。从来没有想过两人会因为什么事情分开。

1969年，空军负责人向刘懋功宣布，云南省革委会查清楚她历史问题，被扣上“叛徒”。甚至提出一些要求，让刘懋功很为难。在当时的形势下，他也没有别的选择，只好表示同意。但对妻子的爱一直放在心里。

他是相信妻子的历史，组织审查、作结论多次，都没有问题，这次群众组织审查就比过去组织做得可靠吗？妻子不在身边，一个人过得很苦，忙工作，形影孤单。

1971年9月以后，情况迎来转机，在与军区副司令肖永银谈话时，聊到妻子，关心问他老伴最近还好吗？他也不清楚，自1968年断了联系谁知道的，但也无奈说一下：大概还可以吧！这辈子想团聚，怕希望不大了。

他的话正好被许世友司令听到，对刘懋功妻子的遭遇很愤慨，当即表示让省委书记吴大胜，叫他派人把人从云南接过来。这让刘懋功看到希望，表示很感谢，觉得家有希望了。

大女儿得知后，主动要求到云南接妈妈回家，带着江苏省革委会的介绍信，在云南革委会副主任的帮助下，事情办得很顺利。虽然余群的问题还没有彻底解决，但能回到身边，还可以工作，刘懋功已经很满足。

到七十年代末，随着平反落实工作展开，余群的历史问题得到彻底解决。