东晋是以皇族和士族共天下的基础建立的朝代，再加上东晋统治阶层绝大多数都是从北方因为躲避战乱迁居南方的，故此东晋从建国那一天开始就有些皇族和士族的矛盾，侨姓士族和本土士族的矛盾，士族和寒族的矛盾，因此东晋王朝存在的一百多年基本上没有太平过，多次爆发叛乱。

东晋元帝明帝期间爆发了王敦之乱，这次叛乱在明帝领导下最终被平定，然而东晋明帝在平定叛乱后还没有及时善后就一病而亡，紧接着新的统治阶层争权夺利最后酿成了新的叛乱，就是苏峻祖约之乱。

晋明帝司马绍死后，他的儿子司马衍继位，不过这个时候司马衍只有四岁，自然无法治国，为此司马绍留下旨意让王导和庾亮两个人为主要负责人辅佐幼主。

而在司马绍死后，大臣们认为虽然王导和庾亮辅政，但是他们毕竟是臣子，不能越过皇帝决定军国大事，于是奏请已经升级为太后的庾文君临朝听政。

太后听政自然重用娘家人，而庾亮就是她的哥哥，因此在心里哥哥自然超过老臣王导，于是在太后支持下，庾亮逐步掌握了朝政大权。

庾亮是有才能的，否则司马绍也不会让他辅佐儿子，可是庾亮的能力和性格并不适合当决定者，就因为他最终爆发了叛乱。

王导辅佐元帝建立政权以来一直担任朝廷一把手，即使王敦叛乱也没有影响他，再加上他的统治手腕确实强，所以上下相安无事，而庾亮一上台，马上一团糟，以至于后来他的外甥司马衍在赐死小舅舅庾怿时都要再提到他说：“大舅已乱天下”。

庾亮依仗自己的特殊身份，不顾实力情况，严苛治国，争权夺利，引的上下不满。南顿王司马宗因为不满庾亮，意图除掉他，结果被庾亮发现最后被杀。而就因为司马宗被杀，他的一个同党卞咸的哥哥卞阐为了逃命跑到苏峻那里，这一举动引起了庾亮的注意，在他看来，苏峻这个人是一大隐患不能不除。

苏峻是东晋大将，在王敦之乱时，带兵参与平定叛乱，为朝廷立下大功，因此升为使持节、冠军将军、历阳内史、加散骑常侍，受封邵陵公。

苏峻有野心，为人骄横，依仗自己兵精粮足在自己地盘为所欲为，根本不把庾亮放在眼里，但是苏峻此时还没有造反的念头，最后庾亮的一顿操作让苏峻反了。

按理说除掉苏峻这种朝廷隐患都要提前布置，秘密进行，还要有善后措施，总之要把这种事对朝廷的危害降到最低。可是庾亮什么计划也没有，他就是想除掉苏峻，而且这个想法居然弄的整个朝廷无人不知无人不晓。

咸和二年（327年），庾亮下达命令征召苏峻入朝担任大司农，加散骑常侍，位特进，并将兵众交给其弟苏逸统领。

这一举动惊动了让整个朝廷，大臣们都认为庾亮这是要杀苏峻，因此纷纷劝说他不要操之过急，缓缓图之。可是庾亮认为应该趁着苏峻势力不强除掉他，等到他势力坐大一切都完了。

而苏峻在接到征召他入朝的消息后，他也知道庾亮瞧不起自己，去建康凶多吉少，他此刻还没有发动叛乱的野心，只想在自己地盘待着，因此多次找各种理由拒绝入朝，甚至提出了转换封地，到荒凉的地方都姓，就是希望就在外地不入朝为官。

然而庾亮一心要弄死苏峻，全部拒绝，坚持苏峻入朝，并且安排自己的弟弟亲信掌管兵权和军事要地防备苏峻造反。

此时苏峻面临两难境地，去建康必死无疑，不去建康直接给了庾亮弄死自己的理由，都是死。他的手下也劝说苏峻，横竖都是死不如直接造反求的一线生机。

苏峻也感到自己想要活下去只能造反，不过自己造反实力难以成功，为此他找到了一向对庾亮不满，恨之入骨的祖约商量造反。

祖约也是东晋一员大将，也参与平定王敦叛乱，但是明帝死后，在公布的遗诏褒奖名单里没有他的名字，因此祖约一直认为庾亮篡改遗诏，后来祖约镇守寿春，面对北方后赵进攻，多次求援都被朝廷拒绝，这让祖约认为是庾亮故意阻挠，为此他对庾亮恨得咬牙切齿。

在听说苏峻要起兵诛杀庾亮后，祖约毫不迟疑马上同意，于是一场新的叛乱马上开始。

对于苏峻坚持不入朝的行为，同样镇守外地的温峤等人都感到不安，他们都要求领兵前往建康，帮助朝廷防备苏峻。可是庾亮接到这些消息后，马上下令不准他们前来，他不想在消灭苏峻后再制造出更多的苏峻来。

在庾亮眼中苏峻很容易对付，因此他开始商量如何防备苏峻。说是商量，其实庾亮拒绝了所有人提出的正确意见，他认为自己再行军打仗上对付苏峻绰绰有余，因此最后按照自己的想法去打仗。

然而苏峻祖约起兵后势如破竹，很快就兵临建康，这个时候庾亮后悔不已，怨恨自己不听大臣的意见，可是后悔归后悔，他还是一再拒绝地方部队领兵前来勤王的意见，同时也拒绝武将的利用苏峻军队不了解地形伏击的建议，使得朝廷大军多次战败，这让庾亮再次后悔，可是后悔已经晚了，苏峻带兵直接攻入建康，庾亮看情况不妙，直接扔下皇帝外甥，和弟弟们逃出建康。

苏峻攻入建康，直接奔向皇宫所在的台城，马上将年幼的司马衍囚禁起来，然后当着司马衍大骂他的舅舅庾亮，吓得司马衍瑟瑟发抖，随后下令大肆劫掠后宫和朝廷国库，将文武百官抓起来发泄心头之恨。

在发泄完了，苏峻给自己加封为骠骑将军、录尚书事，祖约为侍中、太尉、尚书令，其他跟随者全都加官晋爵，一副新王朝的模样。

而逃出去的庾亮也没闲着，他自然不会就这么甘心失败，于是找到温峤，准备组建讨伐苏峻的军队。

而温峤主动联系备受庾亮排挤的征西大将军陶侃，在他的劝说下，一直对庾亮不满的陶侃同意参加平叛队伍，以后庾亮主动向陶侃道歉，最终大家达成了讨伐苏峻的决定。

此后平叛军队和苏峻的叛军开始了对决，虽然苏峻是叛乱，但是苏峻实力和平叛军队旗鼓相当，因此双方各有胜负，一时间双方进入了拉锯战。

不久后，陶侃率兵攻打建康重要军事重地石头城，苏峻亲自带兵救援，然后他的部下匡孝大败平叛军的赵胤，逼得赵胤不得不撤退。

打败了对手，苏峻很高兴，他此刻轻敌了，他马上犒劳手下，喝的大醉突然看了远方的平叛军，他大喊：“孝能破贼，我更不如邪！”意思是说，匡孝都能把敌人打败，难道我就不能？

于是苏峻马上提刀上马带着几个侍卫直接冲了过去，把匡孝等人都看傻了，等到缓过神来为时已晚。

苏峻带人冲到还在逃跑的平叛军中，突然马被绊倒了，他重重摔了下来。而就在不远处陶侃的部下彭世和李千看到了这一幕，他们认识苏峻，这可是千载难逢立功机会，错过了就再也遇不到了，于是拿起长矛直接两根长矛穿过了苏峻的胸膛。之前千军万马都拿他没办法的苏峻就这样死了。

苏峻一死，叛军士气顿时泄气，平叛军士气大振，随后平叛军开始占据优势。

咸和四年（329年）另一叛乱头目祖约见大势已去，在夜里带着左右数百人北逃到后赵。

叛军两个头目一死一逃，剩下的叛军已经是困兽犹斗，最后苏峻的弟弟苏逸苏硕先后兵败被杀，司马衍被平叛军夺回，就这样苏峻祖约叛乱基本上被平定。